Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK7

Chrnb2, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrnb2Q9ERK7 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrnb2Q9ERK7 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrnb2Q9ERK7 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrnb2Q9ERK7 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrnb2Q9ERK7 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrnb2Q9ERK7 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrnb2Q9ERK7 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrnb2Q9ERK7 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrnb2Q9ERK7 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrnb2Q9ERK7 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrnb2Q9ERK7 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrnb2Q9ERK7 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrnb2Q9ERK7 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrnb2Q9ERK7 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrnb2Q9ERK7 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrnb2Q9ERK7 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrnb2Q9ERK7 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrnb2Q9ERK7 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrnb2Q9ERK7 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrnb2Q9ERK7 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrnb2Q9ERK7 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrnb2Q9ERK7 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrnb2Q9ERK7 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chrnb2Q9ERK7 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chrnb2Q9ERK7 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chrnb2Q9ERK7 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chrnb2Q9ERK7 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chrnb2Q9ERK7 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chrnb2Q9ERK7 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chrnb2Q9ERK7 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chrnb2Q9ERK7 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chrnb2Q9ERK7 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Chrnb2Q9ERK7 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chrnb2Q9ERK7 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chrnb2Q9ERK7 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chrnb2Q9ERK7 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chrnb2Q9ERK7 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chrnb2Q9ERK7 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chrnb2Q9ERK7 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chrnb2Q9ERK7 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chrnb2Q9ERK7 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chrnb2Q9ERK7 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chrnb2Q9ERK7 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chrnb2Q9ERK7 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chrnb2Q9ERK7 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chrnb2Q9ERK7 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chrnb2Q9ERK7 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chrnb2Q9ERK7 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chrnb2Q9ERK7 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chrnb2Q9ERK7 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chrnb2Q9ERK7 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chrnb2Q9ERK7 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chrnb2Q9ERK7 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chrnb2Q9ERK7 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chrnb2Q9ERK7 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chrnb2Q9ERK7 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chrnb2Q9ERK7 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chrnb2Q9ERK7 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chrnb2Q9ERK7 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chrnb2Q9ERK7 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chrnb2Q9ERK7 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chrnb2Q9ERK7 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chrnb2Q9ERK7 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chrnb2Q9ERK7 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chrnb2Q9ERK7 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chrnb2Q9ERK7 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chrnb2Q9ERK7 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chrnb2Q9ERK7 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chrnb2Q9ERK7 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chrnb2Q9ERK7 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chrnb2Q9ERK7 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chrnb2Q9ERK7 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chrnb2Q9ERK7 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chrnb2Q9ERK7 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chrnb2Q9ERK7 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chrnb2Q9ERK7 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chrnb2Q9ERK7 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Chrnb2Q9ERK7 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Chrnb2Q9ERK7 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Chrnb2Q9ERK7 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chrnb2Q9ERK7 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chrnb2Q9ERK7 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Chrnb2Q9ERK7 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chrnb2Q9ERK7 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chrnb2Q9ERK7 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chrnb2Q9ERK7 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chrnb2Q9ERK7 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chrnb2Q9ERK7 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chrnb2Q9ERK7 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chrnb2Q9ERK7 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chrnb2Q9ERK7 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chrnb2Q9ERK7 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chrnb2Q9ERK7 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chrnb2Q9ERK7 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Chrnb2Q9ERK7 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Chrnb2Q9ERK7 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chrnb2Q9ERK7 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chrnb2Q9ERK7 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chrnb2Q9ERK7 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chrnb2Q9ERK7 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.5 ms