Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB0

Snap29, Synaptosomal-associated protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap29Q9ERB0 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Snap29Q9ERB0 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snap29Q9ERB0 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snap29Q9ERB0 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snap29Q9ERB0 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snap29Q9ERB0 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snap29Q9ERB0 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snap29Q9ERB0 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snap29Q9ERB0 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snap29Q9ERB0 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snap29Q9ERB0 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snap29Q9ERB0 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snap29Q9ERB0 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snap29Q9ERB0 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snap29Q9ERB0 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snap29Q9ERB0 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snap29Q9ERB0 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snap29Q9ERB0 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snap29Q9ERB0 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snap29Q9ERB0 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snap29Q9ERB0 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snap29Q9ERB0 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snap29Q9ERB0 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snap29Q9ERB0 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snap29Q9ERB0 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snap29Q9ERB0 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snap29Q9ERB0 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snap29Q9ERB0 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snap29Q9ERB0 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snap29Q9ERB0 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snap29Q9ERB0 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snap29Q9ERB0 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snap29Q9ERB0 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snap29Q9ERB0 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snap29Q9ERB0 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snap29Q9ERB0 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snap29Q9ERB0 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snap29Q9ERB0 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snap29Q9ERB0 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snap29Q9ERB0 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snap29Q9ERB0 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snap29Q9ERB0 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snap29Q9ERB0 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snap29Q9ERB0 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Snap29Q9ERB0 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snap29Q9ERB0 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snap29Q9ERB0 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snap29Q9ERB0 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Snap29Q9ERB0 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snap29Q9ERB0 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snap29Q9ERB0 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snap29Q9ERB0 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snap29Q9ERB0 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snap29Q9ERB0 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Snap29Q9ERB0 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snap29Q9ERB0 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snap29Q9ERB0 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snap29Q9ERB0 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snap29Q9ERB0 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snap29Q9ERB0 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snap29Q9ERB0 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snap29Q9ERB0 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snap29Q9ERB0 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snap29Q9ERB0 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Snap29Q9ERB0 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snap29Q9ERB0 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snap29Q9ERB0 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snap29Q9ERB0 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snap29Q9ERB0 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snap29Q9ERB0 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snap29Q9ERB0 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snap29Q9ERB0 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snap29Q9ERB0 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snap29Q9ERB0 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snap29Q9ERB0 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snap29Q9ERB0 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snap29Q9ERB0 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snap29Q9ERB0 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snap29Q9ERB0 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snap29Q9ERB0 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snap29Q9ERB0 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snap29Q9ERB0 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snap29Q9ERB0 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Snap29Q9ERB0 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Snap29Q9ERB0 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
Snap29Q9ERB0 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snap29Q9ERB0 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snap29Q9ERB0 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snap29Q9ERB0 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snap29Q9ERB0 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snap29Q9ERB0 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snap29Q9ERB0 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snap29Q9ERB0 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snap29Q9ERB0 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snap29Q9ERB0 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Snap29Q9ERB0 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snap29Q9ERB0 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snap29Q9ERB0 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snap29Q9ERB0 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snap29Q9ERB0 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms