Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER88

Dap3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dap3Q9ER88 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dap3Q9ER88 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dap3Q9ER88 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dap3Q9ER88 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dap3Q9ER88 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dap3Q9ER88 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dap3Q9ER88 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dap3Q9ER88 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dap3Q9ER88 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dap3Q9ER88 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dap3Q9ER88 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dap3Q9ER88 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dap3Q9ER88 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dap3Q9ER88 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dap3Q9ER88 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dap3Q9ER88 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dap3Q9ER88 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dap3Q9ER88 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Dap3Q9ER88 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dap3Q9ER88 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dap3Q9ER88 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dap3Q9ER88 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dap3Q9ER88 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dap3Q9ER88 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dap3Q9ER88 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dap3Q9ER88 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dap3Q9ER88 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dap3Q9ER88 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dap3Q9ER88 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dap3Q9ER88 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dap3Q9ER88 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dap3Q9ER88 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dap3Q9ER88 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dap3Q9ER88 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dap3Q9ER88 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dap3Q9ER88 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dap3Q9ER88 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dap3Q9ER88 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dap3Q9ER88 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dap3Q9ER88 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dap3Q9ER88 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dap3Q9ER88 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dap3Q9ER88 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dap3Q9ER88 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Dap3Q9ER88 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dap3Q9ER88 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dap3Q9ER88 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dap3Q9ER88 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dap3Q9ER88 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dap3Q9ER88 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dap3Q9ER88 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dap3Q9ER88 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dap3Q9ER88 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dap3Q9ER88 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dap3Q9ER88 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dap3Q9ER88 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dap3Q9ER88 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Dap3Q9ER88 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dap3Q9ER88 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dap3Q9ER88 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Dap3Q9ER88 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Dap3Q9ER88 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dap3Q9ER88 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Dap3Q9ER88 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Dap3Q9ER88 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dap3Q9ER88 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Dap3Q9ER88 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Dap3Q9ER88 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dap3Q9ER88 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dap3Q9ER88 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dap3Q9ER88 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dap3Q9ER88 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dap3Q9ER88 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dap3Q9ER88 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dap3Q9ER88 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Dap3Q9ER88 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Dap3Q9ER88 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Dap3Q9ER88 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Dap3Q9ER88 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Dap3Q9ER88 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dap3Q9ER88 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dap3Q9ER88 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dap3Q9ER88 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dap3Q9ER88 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dap3Q9ER88 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dap3Q9ER88 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dap3Q9ER88 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dap3Q9ER88 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dap3Q9ER88 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dap3Q9ER88 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dap3Q9ER88 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dap3Q9ER88 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dap3Q9ER88 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dap3Q9ER88 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dap3Q9ER88 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dap3Q9ER88 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dap3Q9ER88 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dap3Q9ER88 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dap3Q9ER88 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dap3Q9ER88 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms