Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Clstn2Q9ER65 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Clstn2Q9ER65 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Clstn2Q9ER65 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Clstn2Q9ER65 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Clstn2Q9ER65 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Clstn2Q9ER65 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Clstn2Q9ER65 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Clstn2Q9ER65 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Clstn2Q9ER65 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Clstn2Q9ER65 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Clstn2Q9ER65 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Clstn2Q9ER65 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Clstn2Q9ER65 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Clstn2Q9ER65 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Clstn2Q9ER65 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Clstn2Q9ER65 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Clstn2Q9ER65 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Clstn2Q9ER65 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Clstn2Q9ER65 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Clstn2Q9ER65 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Clstn2Q9ER65 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Clstn2Q9ER65 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Clstn2Q9ER65 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Clstn2Q9ER65 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Clstn2Q9ER65 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Clstn2Q9ER65 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Clstn2Q9ER65 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Clstn2Q9ER65 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Clstn2Q9ER65 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Clstn2Q9ER65 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Clstn2Q9ER65 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Clstn2Q9ER65 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Clstn2Q9ER65 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Clstn2Q9ER65 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Clstn2Q9ER65 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Clstn2Q9ER65 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Clstn2Q9ER65 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Clstn2Q9ER65 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Clstn2Q9ER65 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Clstn2Q9ER65 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Clstn2Q9ER65 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Clstn2Q9ER65 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Clstn2Q9ER65 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Clstn2Q9ER65 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Clstn2Q9ER65 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Clstn2Q9ER65 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Clstn2Q9ER65 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Clstn2Q9ER65 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Clstn2Q9ER65 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Clstn2Q9ER65 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Clstn2Q9ER65 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Clstn2Q9ER65 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Clstn2Q9ER65 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Clstn2Q9ER65 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Clstn2Q9ER65 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Clstn2Q9ER65 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Clstn2Q9ER65 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Clstn2Q9ER65 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Clstn2Q9ER65 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Clstn2Q9ER65 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Clstn2Q9ER65 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Clstn2Q9ER65 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Clstn2Q9ER65 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Clstn2Q9ER65 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Clstn2Q9ER65 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Clstn2Q9ER65 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Clstn2Q9ER65 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Clstn2Q9ER65 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Clstn2Q9ER65 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Clstn2Q9ER65 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Clstn2Q9ER65 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Clstn2Q9ER65 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Clstn2Q9ER65 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Clstn2Q9ER65 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Clstn2Q9ER65 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Clstn2Q9ER65 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Clstn2Q9ER65 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Clstn2Q9ER65 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Clstn2Q9ER65 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Clstn2Q9ER65 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Clstn2Q9ER65 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Clstn2Q9ER65 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Clstn2Q9ER65 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Clstn2Q9ER65 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Clstn2Q9ER65 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Clstn2Q9ER65 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Clstn2Q9ER65 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Clstn2Q9ER65 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Clstn2Q9ER65 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Clstn2Q9ER65 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Clstn2Q9ER65 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Clstn2Q9ER65 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Clstn2Q9ER65 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Clstn2Q9ER65 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Clstn2Q9ER65 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Clstn2Q9ER65 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Clstn2Q9ER65 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Clstn2Q9ER65 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Clstn2Q9ER65 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms