Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER42

Barx1, Homeobox protein BarH-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barx1Q9ER42 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Barx1Q9ER42 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Barx1Q9ER42 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Barx1Q9ER42 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Barx1Q9ER42 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Barx1Q9ER42 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Barx1Q9ER42 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Barx1Q9ER42 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Barx1Q9ER42 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Barx1Q9ER42 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Barx1Q9ER42 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Barx1Q9ER42 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Barx1Q9ER42 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Barx1Q9ER42 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Barx1Q9ER42 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Barx1Q9ER42 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Barx1Q9ER42 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Barx1Q9ER42 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Barx1Q9ER42 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Barx1Q9ER42 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Barx1Q9ER42 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Barx1Q9ER42 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Barx1Q9ER42 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Barx1Q9ER42 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Barx1Q9ER42 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Barx1Q9ER42 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Barx1Q9ER42 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Barx1Q9ER42 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Barx1Q9ER42 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Barx1Q9ER42 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Barx1Q9ER42 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Barx1Q9ER42 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Barx1Q9ER42 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Barx1Q9ER42 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Barx1Q9ER42 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Barx1Q9ER42 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Barx1Q9ER42 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Barx1Q9ER42 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Barx1Q9ER42 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Barx1Q9ER42 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Barx1Q9ER42 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Barx1Q9ER42 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Barx1Q9ER42 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Barx1Q9ER42 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Barx1Q9ER42 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Barx1Q9ER42 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Barx1Q9ER42 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Barx1Q9ER42 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Barx1Q9ER42 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Barx1Q9ER42 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Barx1Q9ER42 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Barx1Q9ER42 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Barx1Q9ER42 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Barx1Q9ER42 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Barx1Q9ER42 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Barx1Q9ER42 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Barx1Q9ER42 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Barx1Q9ER42 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Barx1Q9ER42 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Barx1Q9ER42 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Barx1Q9ER42 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Barx1Q9ER42 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Barx1Q9ER42 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Barx1Q9ER42 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Barx1Q9ER42 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Barx1Q9ER42 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Barx1Q9ER42 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Barx1Q9ER42 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Barx1Q9ER42 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Barx1Q9ER42 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Barx1Q9ER42 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Barx1Q9ER42 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Barx1Q9ER42 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Barx1Q9ER42 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Barx1Q9ER42 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Barx1Q9ER42 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Barx1Q9ER42 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Barx1Q9ER42 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Barx1Q9ER42 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Barx1Q9ER42 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Barx1Q9ER42 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Barx1Q9ER42 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Barx1Q9ER42 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Barx1Q9ER42 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Barx1Q9ER42 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Barx1Q9ER42 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Barx1Q9ER42 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Barx1Q9ER42 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Barx1Q9ER42 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Barx1Q9ER42 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Barx1Q9ER42 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Barx1Q9ER42 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Barx1Q9ER42 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Barx1Q9ER42 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Barx1Q9ER42 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Barx1Q9ER42 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Barx1Q9ER42 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Barx1Q9ER42 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Barx1Q9ER42 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Barx1Q9ER42 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms