Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SgshQ9EQ08 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SgshQ9EQ08 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SgshQ9EQ08 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SgshQ9EQ08 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SgshQ9EQ08 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SgshQ9EQ08 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SgshQ9EQ08 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SgshQ9EQ08 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SgshQ9EQ08 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SgshQ9EQ08 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SgshQ9EQ08 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SgshQ9EQ08 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SgshQ9EQ08 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SgshQ9EQ08 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SgshQ9EQ08 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SgshQ9EQ08 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SgshQ9EQ08 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SgshQ9EQ08 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SgshQ9EQ08 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SgshQ9EQ08 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SgshQ9EQ08 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SgshQ9EQ08 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SgshQ9EQ08 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SgshQ9EQ08 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SgshQ9EQ08 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SgshQ9EQ08 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SgshQ9EQ08 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SgshQ9EQ08 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SgshQ9EQ08 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SgshQ9EQ08 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SgshQ9EQ08 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SgshQ9EQ08 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SgshQ9EQ08 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SgshQ9EQ08 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SgshQ9EQ08 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SgshQ9EQ08 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SgshQ9EQ08 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SgshQ9EQ08 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SgshQ9EQ08 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SgshQ9EQ08 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SgshQ9EQ08 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SgshQ9EQ08 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SgshQ9EQ08 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SgshQ9EQ08 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SgshQ9EQ08 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SgshQ9EQ08 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SgshQ9EQ08 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SgshQ9EQ08 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SgshQ9EQ08 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SgshQ9EQ08 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SgshQ9EQ08 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SgshQ9EQ08 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SgshQ9EQ08 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SgshQ9EQ08 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SgshQ9EQ08 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SgshQ9EQ08 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SgshQ9EQ08 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SgshQ9EQ08 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SgshQ9EQ08 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SgshQ9EQ08 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SgshQ9EQ08 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SgshQ9EQ08 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SgshQ9EQ08 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SgshQ9EQ08 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SgshQ9EQ08 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SgshQ9EQ08 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SgshQ9EQ08 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SgshQ9EQ08 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SgshQ9EQ08 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SgshQ9EQ08 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SgshQ9EQ08 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SgshQ9EQ08 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SgshQ9EQ08 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SgshQ9EQ08 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SgshQ9EQ08 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SgshQ9EQ08 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SgshQ9EQ08 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SgshQ9EQ08 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SgshQ9EQ08 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SgshQ9EQ08 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SgshQ9EQ08 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SgshQ9EQ08 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SgshQ9EQ08 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SgshQ9EQ08 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SgshQ9EQ08 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SgshQ9EQ08 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SgshQ9EQ08 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SgshQ9EQ08 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SgshQ9EQ08 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SgshQ9EQ08 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SgshQ9EQ08 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SgshQ9EQ08 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SgshQ9EQ08 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SgshQ9EQ08 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SgshQ9EQ08 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SgshQ9EQ08 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SgshQ9EQ08 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SgshQ9EQ08 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SgshQ9EQ08 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms