Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPU5

Tnfrsf21, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 21, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf21Q9EPU5 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf21Q9EPU5 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf21Q9EPU5 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf21Q9EPU5 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf21Q9EPU5 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf21Q9EPU5 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf21Q9EPU5 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf21Q9EPU5 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf21Q9EPU5 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf21Q9EPU5 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf21Q9EPU5 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf21Q9EPU5 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf21Q9EPU5 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf21Q9EPU5 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf21Q9EPU5 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf21Q9EPU5 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf21Q9EPU5 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf21Q9EPU5 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf21Q9EPU5 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf21Q9EPU5 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf21Q9EPU5 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf21Q9EPU5 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf21Q9EPU5 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf21Q9EPU5 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf21Q9EPU5 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf21Q9EPU5 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf21Q9EPU5 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf21Q9EPU5 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf21Q9EPU5 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf21Q9EPU5 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf21Q9EPU5 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf21Q9EPU5 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf21Q9EPU5 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf21Q9EPU5 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf21Q9EPU5 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf21Q9EPU5 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf21Q9EPU5 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf21Q9EPU5 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf21Q9EPU5 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf21Q9EPU5 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf21Q9EPU5 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf21Q9EPU5 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf21Q9EPU5 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf21Q9EPU5 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf21Q9EPU5 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf21Q9EPU5 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf21Q9EPU5 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf21Q9EPU5 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf21Q9EPU5 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf21Q9EPU5 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf21Q9EPU5 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf21Q9EPU5 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf21Q9EPU5 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf21Q9EPU5 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf21Q9EPU5 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf21Q9EPU5 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf21Q9EPU5 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf21Q9EPU5 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf21Q9EPU5 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf21Q9EPU5 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf21Q9EPU5 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf21Q9EPU5 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf21Q9EPU5 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf21Q9EPU5 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf21Q9EPU5 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf21Q9EPU5 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf21Q9EPU5 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf21Q9EPU5 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf21Q9EPU5 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf21Q9EPU5 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf21Q9EPU5 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf21Q9EPU5 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf21Q9EPU5 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf21Q9EPU5 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf21Q9EPU5 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf21Q9EPU5 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf21Q9EPU5 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf21Q9EPU5 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf21Q9EPU5 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf21Q9EPU5 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf21Q9EPU5 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf21Q9EPU5 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfrsf21Q9EPU5 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfrsf21Q9EPU5 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfrsf21Q9EPU5 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfrsf21Q9EPU5 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfrsf21Q9EPU5 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfrsf21Q9EPU5 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfrsf21Q9EPU5 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfrsf21Q9EPU5 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfrsf21Q9EPU5 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfrsf21Q9EPU5 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfrsf21Q9EPU5 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms