Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rpgrip1Q9EPQ2 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rpgrip1Q9EPQ2 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rpgrip1Q9EPQ2 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rpgrip1Q9EPQ2 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rpgrip1Q9EPQ2 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Rpgrip1Q9EPQ2 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rpgrip1Q9EPQ2 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rpgrip1Q9EPQ2 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rpgrip1Q9EPQ2 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rpgrip1Q9EPQ2 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Rpgrip1Q9EPQ2 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rpgrip1Q9EPQ2 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rpgrip1Q9EPQ2 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rpgrip1Q9EPQ2 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rpgrip1Q9EPQ2 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Rpgrip1Q9EPQ2 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rpgrip1Q9EPQ2 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rpgrip1Q9EPQ2 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rpgrip1Q9EPQ2 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Rpgrip1Q9EPQ2 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rpgrip1Q9EPQ2 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rpgrip1Q9EPQ2 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rpgrip1Q9EPQ2 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rpgrip1Q9EPQ2 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rpgrip1Q9EPQ2 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Rpgrip1Q9EPQ2 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rpgrip1Q9EPQ2 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Rpgrip1Q9EPQ2 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rpgrip1Q9EPQ2 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rpgrip1Q9EPQ2 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rpgrip1Q9EPQ2 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rpgrip1Q9EPQ2 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rpgrip1Q9EPQ2 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rpgrip1Q9EPQ2 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rpgrip1Q9EPQ2 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Rpgrip1Q9EPQ2 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Rpgrip1Q9EPQ2 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Rpgrip1Q9EPQ2 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
Rpgrip1Q9EPQ2 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Rpgrip1Q9EPQ2 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Rpgrip1Q9EPQ2 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rpgrip1Q9EPQ2 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rpgrip1Q9EPQ2 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rpgrip1Q9EPQ2 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rpgrip1Q9EPQ2 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rpgrip1Q9EPQ2 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rpgrip1Q9EPQ2 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rpgrip1Q9EPQ2 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rpgrip1Q9EPQ2 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rpgrip1Q9EPQ2 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rpgrip1Q9EPQ2 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rpgrip1Q9EPQ2 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rpgrip1Q9EPQ2 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rpgrip1Q9EPQ2 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rpgrip1Q9EPQ2 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rpgrip1Q9EPQ2 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rpgrip1Q9EPQ2 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rpgrip1Q9EPQ2 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rpgrip1Q9EPQ2 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rpgrip1Q9EPQ2 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rpgrip1Q9EPQ2 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rpgrip1Q9EPQ2 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rpgrip1Q9EPQ2 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rpgrip1Q9EPQ2 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rpgrip1Q9EPQ2 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rpgrip1Q9EPQ2 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rpgrip1Q9EPQ2 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Rpgrip1Q9EPQ2 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rpgrip1Q9EPQ2 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rpgrip1Q9EPQ2 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rpgrip1Q9EPQ2 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rpgrip1Q9EPQ2 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rpgrip1Q9EPQ2 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rpgrip1Q9EPQ2 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rpgrip1Q9EPQ2 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rpgrip1Q9EPQ2 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rpgrip1Q9EPQ2 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rpgrip1Q9EPQ2 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rpgrip1Q9EPQ2 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Rpgrip1Q9EPQ2 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rpgrip1Q9EPQ2 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rpgrip1Q9EPQ2 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rpgrip1Q9EPQ2 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rpgrip1Q9EPQ2 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rpgrip1Q9EPQ2 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rpgrip1Q9EPQ2 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rpgrip1Q9EPQ2 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms