Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPM5

Sync, Syncoilin, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SyncQ9EPM5 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SyncQ9EPM5 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SyncQ9EPM5 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SyncQ9EPM5 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SyncQ9EPM5 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SyncQ9EPM5 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SyncQ9EPM5 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SyncQ9EPM5 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SyncQ9EPM5 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SyncQ9EPM5 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SyncQ9EPM5 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SyncQ9EPM5 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SyncQ9EPM5 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SyncQ9EPM5 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SyncQ9EPM5 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SyncQ9EPM5 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SyncQ9EPM5 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SyncQ9EPM5 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SyncQ9EPM5 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SyncQ9EPM5 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SyncQ9EPM5 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SyncQ9EPM5 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SyncQ9EPM5 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SyncQ9EPM5 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SyncQ9EPM5 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SyncQ9EPM5 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SyncQ9EPM5 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SyncQ9EPM5 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SyncQ9EPM5 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SyncQ9EPM5 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SyncQ9EPM5 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SyncQ9EPM5 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SyncQ9EPM5 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SyncQ9EPM5 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SyncQ9EPM5 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SyncQ9EPM5 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SyncQ9EPM5 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SyncQ9EPM5 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SyncQ9EPM5 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SyncQ9EPM5 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SyncQ9EPM5 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SyncQ9EPM5 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SyncQ9EPM5 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SyncQ9EPM5 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SyncQ9EPM5 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SyncQ9EPM5 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SyncQ9EPM5 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SyncQ9EPM5 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SyncQ9EPM5 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SyncQ9EPM5 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SyncQ9EPM5 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SyncQ9EPM5 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SyncQ9EPM5 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SyncQ9EPM5 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SyncQ9EPM5 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SyncQ9EPM5 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SyncQ9EPM5 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SyncQ9EPM5 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SyncQ9EPM5 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SyncQ9EPM5 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SyncQ9EPM5 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SyncQ9EPM5 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SyncQ9EPM5 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SyncQ9EPM5 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SyncQ9EPM5 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SyncQ9EPM5 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SyncQ9EPM5 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SyncQ9EPM5 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SyncQ9EPM5 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SyncQ9EPM5 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SyncQ9EPM5 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SyncQ9EPM5 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SyncQ9EPM5 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SyncQ9EPM5 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SyncQ9EPM5 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SyncQ9EPM5 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SyncQ9EPM5 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SyncQ9EPM5 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SyncQ9EPM5 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SyncQ9EPM5 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SyncQ9EPM5 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SyncQ9EPM5 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SyncQ9EPM5 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SyncQ9EPM5 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SyncQ9EPM5 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SyncQ9EPM5 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SyncQ9EPM5 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SyncQ9EPM5 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SyncQ9EPM5 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SyncQ9EPM5 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SyncQ9EPM5 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SyncQ9EPM5 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SyncQ9EPM5 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SyncQ9EPM5 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SyncQ9EPM5 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SyncQ9EPM5 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SyncQ9EPM5 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SyncQ9EPM5 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SyncQ9EPM5 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SyncQ9EPM5 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms