Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPB7

Gpr88, Probable G-protein coupled receptor 88, mousemouse

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpr88Q9EPB7 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gpr88Q9EPB7 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gpr88Q9EPB7 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gpr88Q9EPB7 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gpr88Q9EPB7 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gpr88Q9EPB7 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gpr88Q9EPB7 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gpr88Q9EPB7 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gpr88Q9EPB7 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gpr88Q9EPB7 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gpr88Q9EPB7 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gpr88Q9EPB7 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gpr88Q9EPB7 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gpr88Q9EPB7 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gpr88Q9EPB7 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gpr88Q9EPB7 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gpr88Q9EPB7 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gpr88Q9EPB7 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gpr88Q9EPB7 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gpr88Q9EPB7 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gpr88Q9EPB7 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gpr88Q9EPB7 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gpr88Q9EPB7 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gpr88Q9EPB7 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gpr88Q9EPB7 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gpr88Q9EPB7 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gpr88Q9EPB7 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gpr88Q9EPB7 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gpr88Q9EPB7 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gpr88Q9EPB7 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gpr88Q9EPB7 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gpr88Q9EPB7 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gpr88Q9EPB7 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gpr88Q9EPB7 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gpr88Q9EPB7 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gpr88Q9EPB7 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gpr88Q9EPB7 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gpr88Q9EPB7 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gpr88Q9EPB7 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gpr88Q9EPB7 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gpr88Q9EPB7 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gpr88Q9EPB7 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gpr88Q9EPB7 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gpr88Q9EPB7 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gpr88Q9EPB7 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gpr88Q9EPB7 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gpr88Q9EPB7 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gpr88Q9EPB7 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gpr88Q9EPB7 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gpr88Q9EPB7 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gpr88Q9EPB7 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gpr88Q9EPB7 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gpr88Q9EPB7 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gpr88Q9EPB7 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gpr88Q9EPB7 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gpr88Q9EPB7 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gpr88Q9EPB7 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gpr88Q9EPB7 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gpr88Q9EPB7 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gpr88Q9EPB7 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gpr88Q9EPB7 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gpr88Q9EPB7 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gpr88Q9EPB7 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gpr88Q9EPB7 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gpr88Q9EPB7 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gpr88Q9EPB7 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gpr88Q9EPB7 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gpr88Q9EPB7 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gpr88Q9EPB7 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gpr88Q9EPB7 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gpr88Q9EPB7 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gpr88Q9EPB7 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gpr88Q9EPB7 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gpr88Q9EPB7 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gpr88Q9EPB7 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gpr88Q9EPB7 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gpr88Q9EPB7 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gpr88Q9EPB7 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gpr88Q9EPB7 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gpr88Q9EPB7 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gpr88Q9EPB7 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gpr88Q9EPB7 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gpr88Q9EPB7 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gpr88Q9EPB7 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gpr88Q9EPB7 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gpr88Q9EPB7 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gpr88Q9EPB7 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gpr88Q9EPB7 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gpr88Q9EPB7 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gpr88Q9EPB7 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gpr88Q9EPB7 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gpr88Q9EPB7 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gpr88Q9EPB7 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gpr88Q9EPB7 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gpr88Q9EPB7 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gpr88Q9EPB7 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gpr88Q9EPB7 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gpr88Q9EPB7 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gpr88Q9EPB7 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gpr88Q9EPB7 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms