Protein–RNA interactions for Protein: Q9DD24

Tceal9, Transcription elongation factor A protein-like 9, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tceal9Q9DD24 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tceal9Q9DD24 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tceal9Q9DD24 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tceal9Q9DD24 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tceal9Q9DD24 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tceal9Q9DD24 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tceal9Q9DD24 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tceal9Q9DD24 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tceal9Q9DD24 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Tceal9Q9DD24 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tceal9Q9DD24 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tceal9Q9DD24 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tceal9Q9DD24 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tceal9Q9DD24 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tceal9Q9DD24 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tceal9Q9DD24 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tceal9Q9DD24 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tceal9Q9DD24 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tceal9Q9DD24 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tceal9Q9DD24 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tceal9Q9DD24 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tceal9Q9DD24 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tceal9Q9DD24 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tceal9Q9DD24 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tceal9Q9DD24 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tceal9Q9DD24 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tceal9Q9DD24 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Tceal9Q9DD24 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tceal9Q9DD24 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tceal9Q9DD24 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tceal9Q9DD24 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tceal9Q9DD24 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tceal9Q9DD24 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tceal9Q9DD24 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tceal9Q9DD24 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tceal9Q9DD24 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tceal9Q9DD24 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Tceal9Q9DD24 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tceal9Q9DD24 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tceal9Q9DD24 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tceal9Q9DD24 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tceal9Q9DD24 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tceal9Q9DD24 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tceal9Q9DD24 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tceal9Q9DD24 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tceal9Q9DD24 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tceal9Q9DD24 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tceal9Q9DD24 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tceal9Q9DD24 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Tceal9Q9DD24 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tceal9Q9DD24 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tceal9Q9DD24 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tceal9Q9DD24 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tceal9Q9DD24 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tceal9Q9DD24 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tceal9Q9DD24 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tceal9Q9DD24 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tceal9Q9DD24 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tceal9Q9DD24 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tceal9Q9DD24 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tceal9Q9DD24 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tceal9Q9DD24 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tceal9Q9DD24 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tceal9Q9DD24 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tceal9Q9DD24 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tceal9Q9DD24 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tceal9Q9DD24 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Tceal9Q9DD24 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tceal9Q9DD24 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tceal9Q9DD24 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tceal9Q9DD24 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Tceal9Q9DD24 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tceal9Q9DD24 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tceal9Q9DD24 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tceal9Q9DD24 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tceal9Q9DD24 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tceal9Q9DD24 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Tceal9Q9DD24 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tceal9Q9DD24 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tceal9Q9DD24 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tceal9Q9DD24 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tceal9Q9DD24 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tceal9Q9DD24 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tceal9Q9DD24 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tceal9Q9DD24 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tceal9Q9DD24 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tceal9Q9DD24 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tceal9Q9DD24 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tceal9Q9DD24 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Tceal9Q9DD24 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tceal9Q9DD24 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tceal9Q9DD24 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tceal9Q9DD24 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tceal9Q9DD24 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tceal9Q9DD24 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tceal9Q9DD24 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tceal9Q9DD24 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tceal9Q9DD24 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Tceal9Q9DD24 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tceal9Q9DD24 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms