Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnft1Q9DCN7 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnft1Q9DCN7 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnft1Q9DCN7 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnft1Q9DCN7 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnft1Q9DCN7 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnft1Q9DCN7 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnft1Q9DCN7 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnft1Q9DCN7 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnft1Q9DCN7 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnft1Q9DCN7 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnft1Q9DCN7 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnft1Q9DCN7 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnft1Q9DCN7 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnft1Q9DCN7 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnft1Q9DCN7 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnft1Q9DCN7 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnft1Q9DCN7 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnft1Q9DCN7 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnft1Q9DCN7 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnft1Q9DCN7 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnft1Q9DCN7 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnft1Q9DCN7 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnft1Q9DCN7 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnft1Q9DCN7 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnft1Q9DCN7 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnft1Q9DCN7 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnft1Q9DCN7 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnft1Q9DCN7 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnft1Q9DCN7 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnft1Q9DCN7 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnft1Q9DCN7 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnft1Q9DCN7 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnft1Q9DCN7 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnft1Q9DCN7 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnft1Q9DCN7 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnft1Q9DCN7 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnft1Q9DCN7 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnft1Q9DCN7 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnft1Q9DCN7 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnft1Q9DCN7 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnft1Q9DCN7 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnft1Q9DCN7 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnft1Q9DCN7 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnft1Q9DCN7 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnft1Q9DCN7 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnft1Q9DCN7 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnft1Q9DCN7 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnft1Q9DCN7 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnft1Q9DCN7 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnft1Q9DCN7 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnft1Q9DCN7 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnft1Q9DCN7 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnft1Q9DCN7 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnft1Q9DCN7 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnft1Q9DCN7 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnft1Q9DCN7 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnft1Q9DCN7 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnft1Q9DCN7 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnft1Q9DCN7 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnft1Q9DCN7 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnft1Q9DCN7 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnft1Q9DCN7 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnft1Q9DCN7 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnft1Q9DCN7 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnft1Q9DCN7 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnft1Q9DCN7 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnft1Q9DCN7 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnft1Q9DCN7 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnft1Q9DCN7 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnft1Q9DCN7 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnft1Q9DCN7 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnft1Q9DCN7 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnft1Q9DCN7 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnft1Q9DCN7 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnft1Q9DCN7 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnft1Q9DCN7 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnft1Q9DCN7 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnft1Q9DCN7 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnft1Q9DCN7 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnft1Q9DCN7 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnft1Q9DCN7 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnft1Q9DCN7 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnft1Q9DCN7 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnft1Q9DCN7 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnft1Q9DCN7 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnft1Q9DCN7 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnft1Q9DCN7 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rnft1Q9DCN7 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rnft1Q9DCN7 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnft1Q9DCN7 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnft1Q9DCN7 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnft1Q9DCN7 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnft1Q9DCN7 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnft1Q9DCN7 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnft1Q9DCN7 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnft1Q9DCN7 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnft1Q9DCN7 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnft1Q9DCN7 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnft1Q9DCN7 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms