Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCH2

Pop7, Ribonuclease P protein subunit p20, mousemouse

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Length 140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop7Q9DCH2 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pop7Q9DCH2 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pop7Q9DCH2 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pop7Q9DCH2 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pop7Q9DCH2 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pop7Q9DCH2 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pop7Q9DCH2 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pop7Q9DCH2 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pop7Q9DCH2 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pop7Q9DCH2 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pop7Q9DCH2 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pop7Q9DCH2 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pop7Q9DCH2 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pop7Q9DCH2 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pop7Q9DCH2 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pop7Q9DCH2 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pop7Q9DCH2 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pop7Q9DCH2 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pop7Q9DCH2 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pop7Q9DCH2 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pop7Q9DCH2 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pop7Q9DCH2 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pop7Q9DCH2 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pop7Q9DCH2 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pop7Q9DCH2 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pop7Q9DCH2 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pop7Q9DCH2 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pop7Q9DCH2 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pop7Q9DCH2 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pop7Q9DCH2 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pop7Q9DCH2 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pop7Q9DCH2 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pop7Q9DCH2 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pop7Q9DCH2 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pop7Q9DCH2 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pop7Q9DCH2 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pop7Q9DCH2 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pop7Q9DCH2 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pop7Q9DCH2 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pop7Q9DCH2 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pop7Q9DCH2 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pop7Q9DCH2 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pop7Q9DCH2 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pop7Q9DCH2 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pop7Q9DCH2 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pop7Q9DCH2 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pop7Q9DCH2 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pop7Q9DCH2 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pop7Q9DCH2 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pop7Q9DCH2 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pop7Q9DCH2 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pop7Q9DCH2 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pop7Q9DCH2 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pop7Q9DCH2 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pop7Q9DCH2 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pop7Q9DCH2 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pop7Q9DCH2 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pop7Q9DCH2 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pop7Q9DCH2 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pop7Q9DCH2 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pop7Q9DCH2 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pop7Q9DCH2 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pop7Q9DCH2 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pop7Q9DCH2 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pop7Q9DCH2 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pop7Q9DCH2 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pop7Q9DCH2 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pop7Q9DCH2 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pop7Q9DCH2 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pop7Q9DCH2 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pop7Q9DCH2 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pop7Q9DCH2 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pop7Q9DCH2 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pop7Q9DCH2 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pop7Q9DCH2 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pop7Q9DCH2 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pop7Q9DCH2 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pop7Q9DCH2 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pop7Q9DCH2 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pop7Q9DCH2 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pop7Q9DCH2 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pop7Q9DCH2 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pop7Q9DCH2 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pop7Q9DCH2 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pop7Q9DCH2 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pop7Q9DCH2 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pop7Q9DCH2 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pop7Q9DCH2 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pop7Q9DCH2 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Pop7Q9DCH2 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pop7Q9DCH2 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pop7Q9DCH2 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Pop7Q9DCH2 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pop7Q9DCH2 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pop7Q9DCH2 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pop7Q9DCH2 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pop7Q9DCH2 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pop7Q9DCH2 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pop7Q9DCH2 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pop7Q9DCH2 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms