Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCB1

Hmgn3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn3Q9DCB1 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hmgn3Q9DCB1 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmgn3Q9DCB1 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmgn3Q9DCB1 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmgn3Q9DCB1 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmgn3Q9DCB1 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmgn3Q9DCB1 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmgn3Q9DCB1 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmgn3Q9DCB1 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmgn3Q9DCB1 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmgn3Q9DCB1 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmgn3Q9DCB1 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmgn3Q9DCB1 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmgn3Q9DCB1 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmgn3Q9DCB1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmgn3Q9DCB1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmgn3Q9DCB1 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmgn3Q9DCB1 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmgn3Q9DCB1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmgn3Q9DCB1 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmgn3Q9DCB1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmgn3Q9DCB1 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmgn3Q9DCB1 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmgn3Q9DCB1 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmgn3Q9DCB1 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmgn3Q9DCB1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmgn3Q9DCB1 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmgn3Q9DCB1 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmgn3Q9DCB1 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmgn3Q9DCB1 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmgn3Q9DCB1 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmgn3Q9DCB1 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmgn3Q9DCB1 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmgn3Q9DCB1 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmgn3Q9DCB1 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmgn3Q9DCB1 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmgn3Q9DCB1 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmgn3Q9DCB1 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmgn3Q9DCB1 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmgn3Q9DCB1 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmgn3Q9DCB1 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmgn3Q9DCB1 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmgn3Q9DCB1 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmgn3Q9DCB1 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmgn3Q9DCB1 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmgn3Q9DCB1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmgn3Q9DCB1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmgn3Q9DCB1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmgn3Q9DCB1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmgn3Q9DCB1 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmgn3Q9DCB1 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmgn3Q9DCB1 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmgn3Q9DCB1 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmgn3Q9DCB1 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmgn3Q9DCB1 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmgn3Q9DCB1 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmgn3Q9DCB1 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmgn3Q9DCB1 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hmgn3Q9DCB1 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hmgn3Q9DCB1 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hmgn3Q9DCB1 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hmgn3Q9DCB1 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmgn3Q9DCB1 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmgn3Q9DCB1 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmgn3Q9DCB1 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmgn3Q9DCB1 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmgn3Q9DCB1 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmgn3Q9DCB1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmgn3Q9DCB1 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmgn3Q9DCB1 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmgn3Q9DCB1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmgn3Q9DCB1 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmgn3Q9DCB1 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmgn3Q9DCB1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmgn3Q9DCB1 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmgn3Q9DCB1 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmgn3Q9DCB1 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmgn3Q9DCB1 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmgn3Q9DCB1 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmgn3Q9DCB1 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmgn3Q9DCB1 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmgn3Q9DCB1 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmgn3Q9DCB1 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmgn3Q9DCB1 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmgn3Q9DCB1 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmgn3Q9DCB1 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmgn3Q9DCB1 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmgn3Q9DCB1 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmgn3Q9DCB1 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmgn3Q9DCB1 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmgn3Q9DCB1 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmgn3Q9DCB1 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmgn3Q9DCB1 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmgn3Q9DCB1 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmgn3Q9DCB1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmgn3Q9DCB1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmgn3Q9DCB1 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmgn3Q9DCB1 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmgn3Q9DCB1 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmgn3Q9DCB1 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms