Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC53

Cpne8, Copine-8, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne8Q9DC53 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cpne8Q9DC53 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cpne8Q9DC53 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cpne8Q9DC53 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cpne8Q9DC53 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Cpne8Q9DC53 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cpne8Q9DC53 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cpne8Q9DC53 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cpne8Q9DC53 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cpne8Q9DC53 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Cpne8Q9DC53 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cpne8Q9DC53 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Cpne8Q9DC53 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cpne8Q9DC53 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cpne8Q9DC53 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cpne8Q9DC53 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cpne8Q9DC53 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cpne8Q9DC53 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cpne8Q9DC53 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Cpne8Q9DC53 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cpne8Q9DC53 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cpne8Q9DC53 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cpne8Q9DC53 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cpne8Q9DC53 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cpne8Q9DC53 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cpne8Q9DC53 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cpne8Q9DC53 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cpne8Q9DC53 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cpne8Q9DC53 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cpne8Q9DC53 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cpne8Q9DC53 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cpne8Q9DC53 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cpne8Q9DC53 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cpne8Q9DC53 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cpne8Q9DC53 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cpne8Q9DC53 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Cpne8Q9DC53 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cpne8Q9DC53 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cpne8Q9DC53 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cpne8Q9DC53 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cpne8Q9DC53 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Cpne8Q9DC53 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cpne8Q9DC53 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Cpne8Q9DC53 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cpne8Q9DC53 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cpne8Q9DC53 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cpne8Q9DC53 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cpne8Q9DC53 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cpne8Q9DC53 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cpne8Q9DC53 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cpne8Q9DC53 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cpne8Q9DC53 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cpne8Q9DC53 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cpne8Q9DC53 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cpne8Q9DC53 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cpne8Q9DC53 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cpne8Q9DC53 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cpne8Q9DC53 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Cpne8Q9DC53 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cpne8Q9DC53 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cpne8Q9DC53 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cpne8Q9DC53 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Cpne8Q9DC53 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cpne8Q9DC53 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cpne8Q9DC53 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cpne8Q9DC53 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cpne8Q9DC53 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cpne8Q9DC53 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cpne8Q9DC53 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cpne8Q9DC53 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cpne8Q9DC53 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Cpne8Q9DC53 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Cpne8Q9DC53 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cpne8Q9DC53 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cpne8Q9DC53 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cpne8Q9DC53 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Cpne8Q9DC53 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cpne8Q9DC53 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cpne8Q9DC53 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cpne8Q9DC53 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cpne8Q9DC53 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cpne8Q9DC53 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cpne8Q9DC53 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cpne8Q9DC53 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cpne8Q9DC53 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cpne8Q9DC53 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cpne8Q9DC53 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cpne8Q9DC53 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cpne8Q9DC53 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cpne8Q9DC53 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cpne8Q9DC53 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cpne8Q9DC53 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cpne8Q9DC53 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cpne8Q9DC53 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cpne8Q9DC53 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cpne8Q9DC53 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cpne8Q9DC53 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cpne8Q9DC53 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cpne8Q9DC53 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cpne8Q9DC53 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms