Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC28

Csnk1d, Casein kinase I isoform delta, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1dQ9DC28 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Csnk1dQ9DC28 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Csnk1dQ9DC28 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Csnk1dQ9DC28 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Csnk1dQ9DC28 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Csnk1dQ9DC28 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Csnk1dQ9DC28 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Csnk1dQ9DC28 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Csnk1dQ9DC28 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Csnk1dQ9DC28 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Csnk1dQ9DC28 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Csnk1dQ9DC28 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Csnk1dQ9DC28 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Csnk1dQ9DC28 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Csnk1dQ9DC28 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Csnk1dQ9DC28 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Csnk1dQ9DC28 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Csnk1dQ9DC28 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Csnk1dQ9DC28 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Csnk1dQ9DC28 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Csnk1dQ9DC28 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Csnk1dQ9DC28 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Csnk1dQ9DC28 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Csnk1dQ9DC28 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Csnk1dQ9DC28 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Csnk1dQ9DC28 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Csnk1dQ9DC28 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Csnk1dQ9DC28 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Csnk1dQ9DC28 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Csnk1dQ9DC28 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Csnk1dQ9DC28 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Csnk1dQ9DC28 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Csnk1dQ9DC28 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Csnk1dQ9DC28 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Csnk1dQ9DC28 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Csnk1dQ9DC28 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Csnk1dQ9DC28 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Csnk1dQ9DC28 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Csnk1dQ9DC28 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Csnk1dQ9DC28 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Csnk1dQ9DC28 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Csnk1dQ9DC28 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Csnk1dQ9DC28 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Csnk1dQ9DC28 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Csnk1dQ9DC28 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Csnk1dQ9DC28 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Csnk1dQ9DC28 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Csnk1dQ9DC28 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Csnk1dQ9DC28 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Csnk1dQ9DC28 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Csnk1dQ9DC28 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Csnk1dQ9DC28 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Csnk1dQ9DC28 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Csnk1dQ9DC28 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Csnk1dQ9DC28 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Csnk1dQ9DC28 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Csnk1dQ9DC28 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Csnk1dQ9DC28 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Csnk1dQ9DC28 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Csnk1dQ9DC28 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Csnk1dQ9DC28 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Csnk1dQ9DC28 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Csnk1dQ9DC28 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Csnk1dQ9DC28 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Csnk1dQ9DC28 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Csnk1dQ9DC28 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Csnk1dQ9DC28 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Csnk1dQ9DC28 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Csnk1dQ9DC28 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Csnk1dQ9DC28 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Csnk1dQ9DC28 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Csnk1dQ9DC28 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Csnk1dQ9DC28 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Csnk1dQ9DC28 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Csnk1dQ9DC28 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Csnk1dQ9DC28 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Csnk1dQ9DC28 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Csnk1dQ9DC28 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Csnk1dQ9DC28 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Csnk1dQ9DC28 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Csnk1dQ9DC28 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Csnk1dQ9DC28 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Csnk1dQ9DC28 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Csnk1dQ9DC28 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Csnk1dQ9DC28 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Csnk1dQ9DC28 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Csnk1dQ9DC28 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Csnk1dQ9DC28 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Csnk1dQ9DC28 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Csnk1dQ9DC28 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Csnk1dQ9DC28 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Csnk1dQ9DC28 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Csnk1dQ9DC28 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Csnk1dQ9DC28 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Csnk1dQ9DC28 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Csnk1dQ9DC28 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Csnk1dQ9DC28 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Csnk1dQ9DC28 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Csnk1dQ9DC28 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Csnk1dQ9DC28 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms