Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBA6

Tysnd1, Peroxisomal leader peptide-processing protease, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tysnd1Q9DBA6 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tysnd1Q9DBA6 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tysnd1Q9DBA6 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tysnd1Q9DBA6 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tysnd1Q9DBA6 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tysnd1Q9DBA6 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tysnd1Q9DBA6 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tysnd1Q9DBA6 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tysnd1Q9DBA6 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tysnd1Q9DBA6 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tysnd1Q9DBA6 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tysnd1Q9DBA6 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tysnd1Q9DBA6 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tysnd1Q9DBA6 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tysnd1Q9DBA6 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tysnd1Q9DBA6 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tysnd1Q9DBA6 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tysnd1Q9DBA6 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tysnd1Q9DBA6 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tysnd1Q9DBA6 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tysnd1Q9DBA6 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tysnd1Q9DBA6 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tysnd1Q9DBA6 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tysnd1Q9DBA6 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tysnd1Q9DBA6 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tysnd1Q9DBA6 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tysnd1Q9DBA6 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tysnd1Q9DBA6 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tysnd1Q9DBA6 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tysnd1Q9DBA6 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tysnd1Q9DBA6 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tysnd1Q9DBA6 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tysnd1Q9DBA6 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tysnd1Q9DBA6 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Tysnd1Q9DBA6 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tysnd1Q9DBA6 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tysnd1Q9DBA6 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tysnd1Q9DBA6 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tysnd1Q9DBA6 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tysnd1Q9DBA6 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tysnd1Q9DBA6 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tysnd1Q9DBA6 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tysnd1Q9DBA6 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tysnd1Q9DBA6 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tysnd1Q9DBA6 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tysnd1Q9DBA6 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tysnd1Q9DBA6 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tysnd1Q9DBA6 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tysnd1Q9DBA6 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tysnd1Q9DBA6 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tysnd1Q9DBA6 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tysnd1Q9DBA6 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tysnd1Q9DBA6 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tysnd1Q9DBA6 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tysnd1Q9DBA6 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tysnd1Q9DBA6 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tysnd1Q9DBA6 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tysnd1Q9DBA6 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tysnd1Q9DBA6 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tysnd1Q9DBA6 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tysnd1Q9DBA6 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tysnd1Q9DBA6 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tysnd1Q9DBA6 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tysnd1Q9DBA6 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tysnd1Q9DBA6 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tysnd1Q9DBA6 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tysnd1Q9DBA6 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tysnd1Q9DBA6 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tysnd1Q9DBA6 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tysnd1Q9DBA6 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tysnd1Q9DBA6 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tysnd1Q9DBA6 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tysnd1Q9DBA6 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tysnd1Q9DBA6 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tysnd1Q9DBA6 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tysnd1Q9DBA6 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tysnd1Q9DBA6 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tysnd1Q9DBA6 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tysnd1Q9DBA6 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tysnd1Q9DBA6 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tysnd1Q9DBA6 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tysnd1Q9DBA6 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tysnd1Q9DBA6 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tysnd1Q9DBA6 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tysnd1Q9DBA6 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tysnd1Q9DBA6 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tysnd1Q9DBA6 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tysnd1Q9DBA6 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tysnd1Q9DBA6 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tysnd1Q9DBA6 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tysnd1Q9DBA6 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tysnd1Q9DBA6 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tysnd1Q9DBA6 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tysnd1Q9DBA6 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tysnd1Q9DBA6 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tysnd1Q9DBA6 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tysnd1Q9DBA6 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tysnd1Q9DBA6 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tysnd1Q9DBA6 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tysnd1Q9DBA6 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms