Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB91

Med29, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 29, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med29Q9DB91 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Med29Q9DB91 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Med29Q9DB91 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Med29Q9DB91 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Med29Q9DB91 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Med29Q9DB91 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Med29Q9DB91 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Med29Q9DB91 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Med29Q9DB91 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Med29Q9DB91 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Med29Q9DB91 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Med29Q9DB91 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Med29Q9DB91 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Med29Q9DB91 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Med29Q9DB91 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Med29Q9DB91 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Med29Q9DB91 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Med29Q9DB91 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Med29Q9DB91 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Med29Q9DB91 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Med29Q9DB91 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Med29Q9DB91 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Med29Q9DB91 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Med29Q9DB91 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Med29Q9DB91 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Med29Q9DB91 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Med29Q9DB91 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Med29Q9DB91 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Med29Q9DB91 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Med29Q9DB91 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Med29Q9DB91 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Med29Q9DB91 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Med29Q9DB91 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Med29Q9DB91 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Med29Q9DB91 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Med29Q9DB91 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Med29Q9DB91 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Med29Q9DB91 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Med29Q9DB91 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Med29Q9DB91 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Med29Q9DB91 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Med29Q9DB91 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Med29Q9DB91 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Med29Q9DB91 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Med29Q9DB91 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Med29Q9DB91 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Med29Q9DB91 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Med29Q9DB91 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Med29Q9DB91 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Med29Q9DB91 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Med29Q9DB91 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Med29Q9DB91 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Med29Q9DB91 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Med29Q9DB91 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Med29Q9DB91 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Med29Q9DB91 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Med29Q9DB91 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Med29Q9DB91 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Med29Q9DB91 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Med29Q9DB91 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Med29Q9DB91 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Med29Q9DB91 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Med29Q9DB91 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Med29Q9DB91 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Med29Q9DB91 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Med29Q9DB91 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Med29Q9DB91 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Med29Q9DB91 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Med29Q9DB91 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Med29Q9DB91 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Med29Q9DB91 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Med29Q9DB91 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Med29Q9DB91 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Med29Q9DB91 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Med29Q9DB91 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Med29Q9DB91 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Med29Q9DB91 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Med29Q9DB91 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Med29Q9DB91 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Med29Q9DB91 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Med29Q9DB91 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Med29Q9DB91 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Med29Q9DB91 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Med29Q9DB91 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Med29Q9DB91 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Med29Q9DB91 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Med29Q9DB91 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Med29Q9DB91 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Med29Q9DB91 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Med29Q9DB91 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Med29Q9DB91 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Med29Q9DB91 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Med29Q9DB91 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Med29Q9DB91 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Med29Q9DB91 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Med29Q9DB91 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Med29Q9DB91 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Med29Q9DB91 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Med29Q9DB91 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Med29Q9DB91 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms