Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB70

Fundc1, FUN14 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fundc1Q9DB70 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fundc1Q9DB70 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fundc1Q9DB70 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fundc1Q9DB70 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fundc1Q9DB70 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fundc1Q9DB70 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fundc1Q9DB70 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fundc1Q9DB70 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fundc1Q9DB70 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fundc1Q9DB70 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fundc1Q9DB70 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fundc1Q9DB70 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fundc1Q9DB70 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Fundc1Q9DB70 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fundc1Q9DB70 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fundc1Q9DB70 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Fundc1Q9DB70 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fundc1Q9DB70 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fundc1Q9DB70 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fundc1Q9DB70 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fundc1Q9DB70 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fundc1Q9DB70 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fundc1Q9DB70 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fundc1Q9DB70 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fundc1Q9DB70 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fundc1Q9DB70 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fundc1Q9DB70 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fundc1Q9DB70 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fundc1Q9DB70 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fundc1Q9DB70 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fundc1Q9DB70 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fundc1Q9DB70 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fundc1Q9DB70 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fundc1Q9DB70 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Fundc1Q9DB70 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fundc1Q9DB70 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fundc1Q9DB70 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fundc1Q9DB70 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fundc1Q9DB70 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fundc1Q9DB70 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fundc1Q9DB70 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fundc1Q9DB70 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Fundc1Q9DB70 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fundc1Q9DB70 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fundc1Q9DB70 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fundc1Q9DB70 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fundc1Q9DB70 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fundc1Q9DB70 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fundc1Q9DB70 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fundc1Q9DB70 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fundc1Q9DB70 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fundc1Q9DB70 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fundc1Q9DB70 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fundc1Q9DB70 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fundc1Q9DB70 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fundc1Q9DB70 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fundc1Q9DB70 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fundc1Q9DB70 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fundc1Q9DB70 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fundc1Q9DB70 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fundc1Q9DB70 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fundc1Q9DB70 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fundc1Q9DB70 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fundc1Q9DB70 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Fundc1Q9DB70 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Fundc1Q9DB70 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fundc1Q9DB70 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fundc1Q9DB70 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fundc1Q9DB70 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fundc1Q9DB70 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fundc1Q9DB70 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fundc1Q9DB70 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fundc1Q9DB70 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fundc1Q9DB70 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fundc1Q9DB70 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fundc1Q9DB70 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fundc1Q9DB70 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fundc1Q9DB70 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fundc1Q9DB70 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fundc1Q9DB70 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fundc1Q9DB70 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fundc1Q9DB70 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fundc1Q9DB70 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fundc1Q9DB70 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fundc1Q9DB70 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fundc1Q9DB70 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fundc1Q9DB70 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fundc1Q9DB70 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fundc1Q9DB70 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fundc1Q9DB70 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fundc1Q9DB70 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fundc1Q9DB70 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fundc1Q9DB70 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fundc1Q9DB70 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fundc1Q9DB70 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fundc1Q9DB70 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fundc1Q9DB70 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fundc1Q9DB70 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fundc1Q9DB70 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fundc1Q9DB70 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms