Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB38

Znf580, Zinc finger protein 580, mousemouse

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Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf580Q9DB38 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Znf580Q9DB38 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Znf580Q9DB38 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Znf580Q9DB38 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Znf580Q9DB38 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Znf580Q9DB38 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Znf580Q9DB38 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Znf580Q9DB38 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf580Q9DB38 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf580Q9DB38 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf580Q9DB38 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf580Q9DB38 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf580Q9DB38 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf580Q9DB38 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf580Q9DB38 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf580Q9DB38 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf580Q9DB38 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf580Q9DB38 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf580Q9DB38 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf580Q9DB38 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf580Q9DB38 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf580Q9DB38 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf580Q9DB38 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf580Q9DB38 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf580Q9DB38 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf580Q9DB38 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf580Q9DB38 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf580Q9DB38 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf580Q9DB38 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf580Q9DB38 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf580Q9DB38 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf580Q9DB38 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Znf580Q9DB38 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf580Q9DB38 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf580Q9DB38 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf580Q9DB38 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf580Q9DB38 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf580Q9DB38 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Znf580Q9DB38 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf580Q9DB38 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf580Q9DB38 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf580Q9DB38 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf580Q9DB38 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf580Q9DB38 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf580Q9DB38 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Znf580Q9DB38 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Znf580Q9DB38 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf580Q9DB38 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf580Q9DB38 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf580Q9DB38 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Znf580Q9DB38 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf580Q9DB38 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf580Q9DB38 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf580Q9DB38 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Znf580Q9DB38 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf580Q9DB38 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Znf580Q9DB38 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf580Q9DB38 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf580Q9DB38 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf580Q9DB38 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf580Q9DB38 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf580Q9DB38 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf580Q9DB38 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf580Q9DB38 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf580Q9DB38 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf580Q9DB38 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Znf580Q9DB38 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf580Q9DB38 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf580Q9DB38 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf580Q9DB38 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf580Q9DB38 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf580Q9DB38 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf580Q9DB38 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf580Q9DB38 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf580Q9DB38 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf580Q9DB38 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Znf580Q9DB38 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Znf580Q9DB38 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Znf580Q9DB38 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Znf580Q9DB38 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Znf580Q9DB38 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Znf580Q9DB38 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Znf580Q9DB38 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Znf580Q9DB38 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Znf580Q9DB38 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Znf580Q9DB38 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Znf580Q9DB38 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Znf580Q9DB38 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Znf580Q9DB38 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Znf580Q9DB38 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Znf580Q9DB38 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Znf580Q9DB38 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms