Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pop5Q9DB28 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pop5Q9DB28 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pop5Q9DB28 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pop5Q9DB28 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pop5Q9DB28 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pop5Q9DB28 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pop5Q9DB28 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pop5Q9DB28 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pop5Q9DB28 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pop5Q9DB28 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pop5Q9DB28 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pop5Q9DB28 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pop5Q9DB28 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pop5Q9DB28 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pop5Q9DB28 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pop5Q9DB28 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pop5Q9DB28 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pop5Q9DB28 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pop5Q9DB28 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pop5Q9DB28 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pop5Q9DB28 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pop5Q9DB28 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pop5Q9DB28 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pop5Q9DB28 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pop5Q9DB28 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pop5Q9DB28 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pop5Q9DB28 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pop5Q9DB28 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pop5Q9DB28 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pop5Q9DB28 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pop5Q9DB28 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pop5Q9DB28 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pop5Q9DB28 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pop5Q9DB28 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pop5Q9DB28 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pop5Q9DB28 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pop5Q9DB28 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pop5Q9DB28 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pop5Q9DB28 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pop5Q9DB28 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pop5Q9DB28 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pop5Q9DB28 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pop5Q9DB28 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pop5Q9DB28 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pop5Q9DB28 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pop5Q9DB28 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pop5Q9DB28 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pop5Q9DB28 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pop5Q9DB28 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pop5Q9DB28 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pop5Q9DB28 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pop5Q9DB28 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pop5Q9DB28 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pop5Q9DB28 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Pop5Q9DB28 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pop5Q9DB28 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pop5Q9DB28 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pop5Q9DB28 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pop5Q9DB28 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pop5Q9DB28 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pop5Q9DB28 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pop5Q9DB28 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pop5Q9DB28 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pop5Q9DB28 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pop5Q9DB28 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pop5Q9DB28 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pop5Q9DB28 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pop5Q9DB28 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pop5Q9DB28 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pop5Q9DB28 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pop5Q9DB28 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pop5Q9DB28 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pop5Q9DB28 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pop5Q9DB28 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pop5Q9DB28 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pop5Q9DB28 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pop5Q9DB28 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pop5Q9DB28 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pop5Q9DB28 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pop5Q9DB28 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pop5Q9DB28 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pop5Q9DB28 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pop5Q9DB28 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pop5Q9DB28 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pop5Q9DB28 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Pop5Q9DB28 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Pop5Q9DB28 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pop5Q9DB28 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pop5Q9DB28 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pop5Q9DB28 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pop5Q9DB28 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pop5Q9DB28 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pop5Q9DB28 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pop5Q9DB28 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Pop5Q9DB28 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pop5Q9DB28 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pop5Q9DB28 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pop5Q9DB28 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pop5Q9DB28 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms