Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAT5

Trmu, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrmuQ9DAT5 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TrmuQ9DAT5 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TrmuQ9DAT5 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TrmuQ9DAT5 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TrmuQ9DAT5 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TrmuQ9DAT5 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TrmuQ9DAT5 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TrmuQ9DAT5 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TrmuQ9DAT5 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TrmuQ9DAT5 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TrmuQ9DAT5 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TrmuQ9DAT5 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TrmuQ9DAT5 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TrmuQ9DAT5 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TrmuQ9DAT5 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TrmuQ9DAT5 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TrmuQ9DAT5 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TrmuQ9DAT5 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TrmuQ9DAT5 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TrmuQ9DAT5 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TrmuQ9DAT5 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TrmuQ9DAT5 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TrmuQ9DAT5 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TrmuQ9DAT5 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TrmuQ9DAT5 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TrmuQ9DAT5 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TrmuQ9DAT5 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TrmuQ9DAT5 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TrmuQ9DAT5 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TrmuQ9DAT5 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TrmuQ9DAT5 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TrmuQ9DAT5 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TrmuQ9DAT5 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TrmuQ9DAT5 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TrmuQ9DAT5 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TrmuQ9DAT5 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TrmuQ9DAT5 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TrmuQ9DAT5 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TrmuQ9DAT5 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TrmuQ9DAT5 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TrmuQ9DAT5 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TrmuQ9DAT5 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TrmuQ9DAT5 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TrmuQ9DAT5 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TrmuQ9DAT5 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TrmuQ9DAT5 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TrmuQ9DAT5 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TrmuQ9DAT5 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TrmuQ9DAT5 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TrmuQ9DAT5 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TrmuQ9DAT5 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TrmuQ9DAT5 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TrmuQ9DAT5 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TrmuQ9DAT5 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TrmuQ9DAT5 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TrmuQ9DAT5 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TrmuQ9DAT5 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TrmuQ9DAT5 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TrmuQ9DAT5 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TrmuQ9DAT5 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TrmuQ9DAT5 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TrmuQ9DAT5 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TrmuQ9DAT5 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TrmuQ9DAT5 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TrmuQ9DAT5 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TrmuQ9DAT5 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TrmuQ9DAT5 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TrmuQ9DAT5 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TrmuQ9DAT5 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TrmuQ9DAT5 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TrmuQ9DAT5 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TrmuQ9DAT5 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TrmuQ9DAT5 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TrmuQ9DAT5 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TrmuQ9DAT5 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TrmuQ9DAT5 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TrmuQ9DAT5 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TrmuQ9DAT5 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TrmuQ9DAT5 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TrmuQ9DAT5 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TrmuQ9DAT5 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TrmuQ9DAT5 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TrmuQ9DAT5 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TrmuQ9DAT5 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TrmuQ9DAT5 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TrmuQ9DAT5 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TrmuQ9DAT5 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TrmuQ9DAT5 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TrmuQ9DAT5 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TrmuQ9DAT5 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TrmuQ9DAT5 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TrmuQ9DAT5 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TrmuQ9DAT5 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TrmuQ9DAT5 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TrmuQ9DAT5 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TrmuQ9DAT5 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TrmuQ9DAT5 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TrmuQ9DAT5 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TrmuQ9DAT5 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TrmuQ9DAT5 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms