Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAP7

Asf1b, Histone chaperone ASF1B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asf1bQ9DAP7 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Asf1bQ9DAP7 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Asf1bQ9DAP7 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Asf1bQ9DAP7 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Asf1bQ9DAP7 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Asf1bQ9DAP7 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Asf1bQ9DAP7 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Asf1bQ9DAP7 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Asf1bQ9DAP7 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Asf1bQ9DAP7 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Asf1bQ9DAP7 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Asf1bQ9DAP7 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Asf1bQ9DAP7 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Asf1bQ9DAP7 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Asf1bQ9DAP7 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Asf1bQ9DAP7 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms