Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA39

Tmbim4, Protein lifeguard 4, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmbim4Q9DA39 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmbim4Q9DA39 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmbim4Q9DA39 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmbim4Q9DA39 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmbim4Q9DA39 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmbim4Q9DA39 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmbim4Q9DA39 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmbim4Q9DA39 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmbim4Q9DA39 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmbim4Q9DA39 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmbim4Q9DA39 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmbim4Q9DA39 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmbim4Q9DA39 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmbim4Q9DA39 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmbim4Q9DA39 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmbim4Q9DA39 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmbim4Q9DA39 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmbim4Q9DA39 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmbim4Q9DA39 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmbim4Q9DA39 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmbim4Q9DA39 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmbim4Q9DA39 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmbim4Q9DA39 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmbim4Q9DA39 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmbim4Q9DA39 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmbim4Q9DA39 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmbim4Q9DA39 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmbim4Q9DA39 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmbim4Q9DA39 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmbim4Q9DA39 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmbim4Q9DA39 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmbim4Q9DA39 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmbim4Q9DA39 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmbim4Q9DA39 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmbim4Q9DA39 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmbim4Q9DA39 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmbim4Q9DA39 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmbim4Q9DA39 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmbim4Q9DA39 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmbim4Q9DA39 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmbim4Q9DA39 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmbim4Q9DA39 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmbim4Q9DA39 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmbim4Q9DA39 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmbim4Q9DA39 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmbim4Q9DA39 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmbim4Q9DA39 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmbim4Q9DA39 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmbim4Q9DA39 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmbim4Q9DA39 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmbim4Q9DA39 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmbim4Q9DA39 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmbim4Q9DA39 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmbim4Q9DA39 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmbim4Q9DA39 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmbim4Q9DA39 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmbim4Q9DA39 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmbim4Q9DA39 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmbim4Q9DA39 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmbim4Q9DA39 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmbim4Q9DA39 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmbim4Q9DA39 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmbim4Q9DA39 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmbim4Q9DA39 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmbim4Q9DA39 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmbim4Q9DA39 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmbim4Q9DA39 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmbim4Q9DA39 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmbim4Q9DA39 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmbim4Q9DA39 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmbim4Q9DA39 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmbim4Q9DA39 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmbim4Q9DA39 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmbim4Q9DA39 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmbim4Q9DA39 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmbim4Q9DA39 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmbim4Q9DA39 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmbim4Q9DA39 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmbim4Q9DA39 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmbim4Q9DA39 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmbim4Q9DA39 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmbim4Q9DA39 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmbim4Q9DA39 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmbim4Q9DA39 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmbim4Q9DA39 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmbim4Q9DA39 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmbim4Q9DA39 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmbim4Q9DA39 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmbim4Q9DA39 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmbim4Q9DA39 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmbim4Q9DA39 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmbim4Q9DA39 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmbim4Q9DA39 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmbim4Q9DA39 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmbim4Q9DA39 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmbim4Q9DA39 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmbim4Q9DA39 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmbim4Q9DA39 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmbim4Q9DA39 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmbim4Q9DA39 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms