Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9J3

Actrt1, Actin-related protein T1, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actrt1Q9D9J3 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Actrt1Q9D9J3 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Actrt1Q9D9J3 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Actrt1Q9D9J3 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Actrt1Q9D9J3 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Actrt1Q9D9J3 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Actrt1Q9D9J3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Actrt1Q9D9J3 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Actrt1Q9D9J3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Actrt1Q9D9J3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Actrt1Q9D9J3 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Actrt1Q9D9J3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Actrt1Q9D9J3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Actrt1Q9D9J3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Actrt1Q9D9J3 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Actrt1Q9D9J3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Actrt1Q9D9J3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Actrt1Q9D9J3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Actrt1Q9D9J3 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Actrt1Q9D9J3 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Actrt1Q9D9J3 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Actrt1Q9D9J3 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Actrt1Q9D9J3 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Actrt1Q9D9J3 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Actrt1Q9D9J3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Actrt1Q9D9J3 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Actrt1Q9D9J3 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Actrt1Q9D9J3 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Actrt1Q9D9J3 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Actrt1Q9D9J3 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Actrt1Q9D9J3 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Actrt1Q9D9J3 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Actrt1Q9D9J3 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Actrt1Q9D9J3 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Actrt1Q9D9J3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Actrt1Q9D9J3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Actrt1Q9D9J3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Actrt1Q9D9J3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Actrt1Q9D9J3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Actrt1Q9D9J3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Actrt1Q9D9J3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Actrt1Q9D9J3 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Actrt1Q9D9J3 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Actrt1Q9D9J3 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Actrt1Q9D9J3 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Actrt1Q9D9J3 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Actrt1Q9D9J3 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Actrt1Q9D9J3 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Actrt1Q9D9J3 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Actrt1Q9D9J3 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Actrt1Q9D9J3 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Actrt1Q9D9J3 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Actrt1Q9D9J3 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Actrt1Q9D9J3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Actrt1Q9D9J3 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Actrt1Q9D9J3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Actrt1Q9D9J3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Actrt1Q9D9J3 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Actrt1Q9D9J3 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Actrt1Q9D9J3 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Actrt1Q9D9J3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Actrt1Q9D9J3 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Actrt1Q9D9J3 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Actrt1Q9D9J3 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Actrt1Q9D9J3 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Actrt1Q9D9J3 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Actrt1Q9D9J3 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Actrt1Q9D9J3 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Actrt1Q9D9J3 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Actrt1Q9D9J3 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Actrt1Q9D9J3 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Actrt1Q9D9J3 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Actrt1Q9D9J3 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Actrt1Q9D9J3 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Actrt1Q9D9J3 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Actrt1Q9D9J3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Actrt1Q9D9J3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Actrt1Q9D9J3 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Actrt1Q9D9J3 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Actrt1Q9D9J3 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Actrt1Q9D9J3 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Actrt1Q9D9J3 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Actrt1Q9D9J3 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Actrt1Q9D9J3 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Actrt1Q9D9J3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Actrt1Q9D9J3 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Actrt1Q9D9J3 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Actrt1Q9D9J3 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Actrt1Q9D9J3 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Actrt1Q9D9J3 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Actrt1Q9D9J3 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Actrt1Q9D9J3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Actrt1Q9D9J3 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Actrt1Q9D9J3 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Actrt1Q9D9J3 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Actrt1Q9D9J3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Actrt1Q9D9J3 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Actrt1Q9D9J3 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Actrt1Q9D9J3 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Actrt1Q9D9J3 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms