Protein–RNA interactions for Protein: Q9D906

Atg7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg7Q9D906 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg7Q9D906 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg7Q9D906 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg7Q9D906 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg7Q9D906 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg7Q9D906 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg7Q9D906 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg7Q9D906 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg7Q9D906 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg7Q9D906 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg7Q9D906 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg7Q9D906 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg7Q9D906 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg7Q9D906 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg7Q9D906 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg7Q9D906 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg7Q9D906 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg7Q9D906 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg7Q9D906 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg7Q9D906 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg7Q9D906 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg7Q9D906 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg7Q9D906 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg7Q9D906 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg7Q9D906 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg7Q9D906 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg7Q9D906 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg7Q9D906 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg7Q9D906 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg7Q9D906 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg7Q9D906 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg7Q9D906 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg7Q9D906 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg7Q9D906 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg7Q9D906 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg7Q9D906 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg7Q9D906 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg7Q9D906 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg7Q9D906 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg7Q9D906 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg7Q9D906 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg7Q9D906 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg7Q9D906 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg7Q9D906 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg7Q9D906 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg7Q9D906 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg7Q9D906 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg7Q9D906 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg7Q9D906 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg7Q9D906 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg7Q9D906 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg7Q9D906 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg7Q9D906 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg7Q9D906 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg7Q9D906 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg7Q9D906 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg7Q9D906 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg7Q9D906 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg7Q9D906 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg7Q9D906 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg7Q9D906 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg7Q9D906 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg7Q9D906 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atg7Q9D906 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atg7Q9D906 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atg7Q9D906 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atg7Q9D906 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atg7Q9D906 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atg7Q9D906 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atg7Q9D906 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atg7Q9D906 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atg7Q9D906 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atg7Q9D906 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atg7Q9D906 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Atg7Q9D906 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Atg7Q9D906 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atg7Q9D906 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atg7Q9D906 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atg7Q9D906 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atg7Q9D906 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atg7Q9D906 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atg7Q9D906 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atg7Q9D906 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atg7Q9D906 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg7Q9D906 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg7Q9D906 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg7Q9D906 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg7Q9D906 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg7Q9D906 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg7Q9D906 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg7Q9D906 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg7Q9D906 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg7Q9D906 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg7Q9D906 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg7Q9D906 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg7Q9D906 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg7Q9D906 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg7Q9D906 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg7Q9D906 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg7Q9D906 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms