Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx5Q9D8U8 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx5Q9D8U8 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx5Q9D8U8 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx5Q9D8U8 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx5Q9D8U8 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx5Q9D8U8 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx5Q9D8U8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx5Q9D8U8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx5Q9D8U8 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx5Q9D8U8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx5Q9D8U8 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx5Q9D8U8 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx5Q9D8U8 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx5Q9D8U8 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx5Q9D8U8 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx5Q9D8U8 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx5Q9D8U8 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx5Q9D8U8 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx5Q9D8U8 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx5Q9D8U8 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx5Q9D8U8 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx5Q9D8U8 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx5Q9D8U8 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx5Q9D8U8 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx5Q9D8U8 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx5Q9D8U8 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx5Q9D8U8 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx5Q9D8U8 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx5Q9D8U8 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx5Q9D8U8 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx5Q9D8U8 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx5Q9D8U8 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx5Q9D8U8 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx5Q9D8U8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx5Q9D8U8 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx5Q9D8U8 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx5Q9D8U8 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx5Q9D8U8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx5Q9D8U8 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx5Q9D8U8 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx5Q9D8U8 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx5Q9D8U8 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx5Q9D8U8 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx5Q9D8U8 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx5Q9D8U8 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx5Q9D8U8 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx5Q9D8U8 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx5Q9D8U8 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx5Q9D8U8 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx5Q9D8U8 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx5Q9D8U8 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx5Q9D8U8 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx5Q9D8U8 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx5Q9D8U8 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx5Q9D8U8 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx5Q9D8U8 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx5Q9D8U8 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx5Q9D8U8 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx5Q9D8U8 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx5Q9D8U8 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx5Q9D8U8 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx5Q9D8U8 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx5Q9D8U8 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx5Q9D8U8 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx5Q9D8U8 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx5Q9D8U8 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx5Q9D8U8 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx5Q9D8U8 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx5Q9D8U8 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx5Q9D8U8 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx5Q9D8U8 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx5Q9D8U8 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx5Q9D8U8 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx5Q9D8U8 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx5Q9D8U8 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx5Q9D8U8 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx5Q9D8U8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx5Q9D8U8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx5Q9D8U8 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx5Q9D8U8 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx5Q9D8U8 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx5Q9D8U8 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx5Q9D8U8 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx5Q9D8U8 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx5Q9D8U8 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx5Q9D8U8 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx5Q9D8U8 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx5Q9D8U8 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx5Q9D8U8 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx5Q9D8U8 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx5Q9D8U8 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx5Q9D8U8 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx5Q9D8U8 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx5Q9D8U8 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx5Q9D8U8 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx5Q9D8U8 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx5Q9D8U8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx5Q9D8U8 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx5Q9D8U8 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms