Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8N6

Lin37, Protein lin-37 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin37Q9D8N6 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lin37Q9D8N6 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Lin37Q9D8N6 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Lin37Q9D8N6 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lin37Q9D8N6 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lin37Q9D8N6 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lin37Q9D8N6 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Lin37Q9D8N6 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lin37Q9D8N6 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lin37Q9D8N6 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lin37Q9D8N6 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lin37Q9D8N6 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lin37Q9D8N6 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lin37Q9D8N6 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lin37Q9D8N6 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lin37Q9D8N6 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lin37Q9D8N6 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lin37Q9D8N6 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lin37Q9D8N6 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lin37Q9D8N6 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lin37Q9D8N6 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lin37Q9D8N6 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lin37Q9D8N6 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lin37Q9D8N6 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lin37Q9D8N6 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lin37Q9D8N6 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lin37Q9D8N6 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lin37Q9D8N6 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lin37Q9D8N6 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lin37Q9D8N6 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lin37Q9D8N6 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lin37Q9D8N6 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lin37Q9D8N6 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Lin37Q9D8N6 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lin37Q9D8N6 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lin37Q9D8N6 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lin37Q9D8N6 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lin37Q9D8N6 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lin37Q9D8N6 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lin37Q9D8N6 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lin37Q9D8N6 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lin37Q9D8N6 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lin37Q9D8N6 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lin37Q9D8N6 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lin37Q9D8N6 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lin37Q9D8N6 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lin37Q9D8N6 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lin37Q9D8N6 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lin37Q9D8N6 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lin37Q9D8N6 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lin37Q9D8N6 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lin37Q9D8N6 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lin37Q9D8N6 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lin37Q9D8N6 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lin37Q9D8N6 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lin37Q9D8N6 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Lin37Q9D8N6 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lin37Q9D8N6 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lin37Q9D8N6 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lin37Q9D8N6 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Lin37Q9D8N6 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lin37Q9D8N6 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lin37Q9D8N6 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lin37Q9D8N6 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lin37Q9D8N6 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lin37Q9D8N6 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Lin37Q9D8N6 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lin37Q9D8N6 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lin37Q9D8N6 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lin37Q9D8N6 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Lin37Q9D8N6 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lin37Q9D8N6 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lin37Q9D8N6 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lin37Q9D8N6 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Lin37Q9D8N6 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Lin37Q9D8N6 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lin37Q9D8N6 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lin37Q9D8N6 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lin37Q9D8N6 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lin37Q9D8N6 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lin37Q9D8N6 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Lin37Q9D8N6 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Lin37Q9D8N6 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lin37Q9D8N6 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Lin37Q9D8N6 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lin37Q9D8N6 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lin37Q9D8N6 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lin37Q9D8N6 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lin37Q9D8N6 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lin37Q9D8N6 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lin37Q9D8N6 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lin37Q9D8N6 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lin37Q9D8N6 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lin37Q9D8N6 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lin37Q9D8N6 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lin37Q9D8N6 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lin37Q9D8N6 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lin37Q9D8N6 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lin37Q9D8N6 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lin37Q9D8N6 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms