Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8E6

Rpl4, 60S ribosomal protein L4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl4Q9D8E6 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpl4Q9D8E6 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpl4Q9D8E6 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpl4Q9D8E6 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpl4Q9D8E6 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpl4Q9D8E6 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpl4Q9D8E6 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpl4Q9D8E6 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpl4Q9D8E6 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpl4Q9D8E6 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpl4Q9D8E6 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpl4Q9D8E6 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpl4Q9D8E6 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpl4Q9D8E6 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpl4Q9D8E6 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpl4Q9D8E6 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpl4Q9D8E6 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpl4Q9D8E6 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpl4Q9D8E6 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpl4Q9D8E6 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpl4Q9D8E6 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpl4Q9D8E6 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpl4Q9D8E6 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rpl4Q9D8E6 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Rpl4Q9D8E6 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rpl4Q9D8E6 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rpl4Q9D8E6 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rpl4Q9D8E6 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Rpl4Q9D8E6 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rpl4Q9D8E6 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Rpl4Q9D8E6 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rpl4Q9D8E6 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Rpl4Q9D8E6 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rpl4Q9D8E6 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rpl4Q9D8E6 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rpl4Q9D8E6 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rpl4Q9D8E6 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rpl4Q9D8E6 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rpl4Q9D8E6 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rpl4Q9D8E6 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Rpl4Q9D8E6 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rpl4Q9D8E6 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rpl4Q9D8E6 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rpl4Q9D8E6 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rpl4Q9D8E6 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rpl4Q9D8E6 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Rpl4Q9D8E6 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Rpl4Q9D8E6 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rpl4Q9D8E6 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rpl4Q9D8E6 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rpl4Q9D8E6 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rpl4Q9D8E6 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rpl4Q9D8E6 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rpl4Q9D8E6 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rpl4Q9D8E6 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rpl4Q9D8E6 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Rpl4Q9D8E6 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rpl4Q9D8E6 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rpl4Q9D8E6 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rpl4Q9D8E6 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpl4Q9D8E6 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpl4Q9D8E6 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpl4Q9D8E6 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpl4Q9D8E6 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpl4Q9D8E6 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpl4Q9D8E6 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpl4Q9D8E6 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpl4Q9D8E6 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpl4Q9D8E6 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpl4Q9D8E6 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpl4Q9D8E6 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpl4Q9D8E6 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpl4Q9D8E6 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpl4Q9D8E6 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpl4Q9D8E6 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpl4Q9D8E6 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpl4Q9D8E6 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpl4Q9D8E6 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpl4Q9D8E6 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpl4Q9D8E6 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpl4Q9D8E6 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpl4Q9D8E6 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rpl4Q9D8E6 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rpl4Q9D8E6 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rpl4Q9D8E6 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rpl4Q9D8E6 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rpl4Q9D8E6 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rpl4Q9D8E6 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rpl4Q9D8E6 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rpl4Q9D8E6 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Rpl4Q9D8E6 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rpl4Q9D8E6 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rpl4Q9D8E6 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rpl4Q9D8E6 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rpl4Q9D8E6 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rpl4Q9D8E6 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rpl4Q9D8E6 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rpl4Q9D8E6 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rpl4Q9D8E6 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rpl4Q9D8E6 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms