Protein–RNA interactions for Protein: Q9D883

U2af1, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af1Q9D883 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
U2af1Q9D883 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
U2af1Q9D883 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
U2af1Q9D883 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
U2af1Q9D883 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
U2af1Q9D883 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
U2af1Q9D883 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
U2af1Q9D883 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
U2af1Q9D883 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
U2af1Q9D883 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
U2af1Q9D883 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
U2af1Q9D883 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
U2af1Q9D883 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
U2af1Q9D883 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
U2af1Q9D883 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
U2af1Q9D883 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
U2af1Q9D883 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
U2af1Q9D883 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
U2af1Q9D883 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
U2af1Q9D883 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
U2af1Q9D883 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
U2af1Q9D883 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
U2af1Q9D883 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
U2af1Q9D883 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
U2af1Q9D883 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
U2af1Q9D883 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
U2af1Q9D883 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
U2af1Q9D883 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
U2af1Q9D883 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
U2af1Q9D883 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
U2af1Q9D883 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
U2af1Q9D883 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
U2af1Q9D883 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
U2af1Q9D883 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
U2af1Q9D883 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
U2af1Q9D883 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
U2af1Q9D883 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
U2af1Q9D883 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
U2af1Q9D883 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
U2af1Q9D883 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
U2af1Q9D883 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
U2af1Q9D883 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
U2af1Q9D883 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
U2af1Q9D883 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
U2af1Q9D883 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
U2af1Q9D883 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
U2af1Q9D883 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
U2af1Q9D883 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
U2af1Q9D883 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
U2af1Q9D883 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
U2af1Q9D883 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
U2af1Q9D883 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
U2af1Q9D883 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
U2af1Q9D883 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
U2af1Q9D883 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
U2af1Q9D883 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
U2af1Q9D883 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
U2af1Q9D883 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
U2af1Q9D883 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
U2af1Q9D883 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
U2af1Q9D883 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
U2af1Q9D883 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
U2af1Q9D883 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
U2af1Q9D883 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
U2af1Q9D883 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
U2af1Q9D883 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
U2af1Q9D883 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
U2af1Q9D883 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
U2af1Q9D883 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
U2af1Q9D883 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
U2af1Q9D883 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
U2af1Q9D883 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
U2af1Q9D883 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
U2af1Q9D883 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
U2af1Q9D883 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
U2af1Q9D883 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
U2af1Q9D883 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
U2af1Q9D883 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
U2af1Q9D883 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
U2af1Q9D883 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
U2af1Q9D883 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
U2af1Q9D883 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
U2af1Q9D883 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
U2af1Q9D883 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
U2af1Q9D883 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
U2af1Q9D883 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
U2af1Q9D883 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
U2af1Q9D883 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
U2af1Q9D883 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
U2af1Q9D883 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
U2af1Q9D883 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
U2af1Q9D883 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
U2af1Q9D883 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
U2af1Q9D883 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
U2af1Q9D883 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
U2af1Q9D883 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
U2af1Q9D883 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
U2af1Q9D883 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
U2af1Q9D883 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
U2af1Q9D883 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms