Protein–RNA interactions for Protein: Q9D806

Vstm5, V-set and transmembrane domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm5Q9D806 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Vstm5Q9D806 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vstm5Q9D806 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vstm5Q9D806 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Vstm5Q9D806 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vstm5Q9D806 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vstm5Q9D806 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Vstm5Q9D806 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vstm5Q9D806 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Vstm5Q9D806 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Vstm5Q9D806 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Vstm5Q9D806 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vstm5Q9D806 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vstm5Q9D806 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vstm5Q9D806 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vstm5Q9D806 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vstm5Q9D806 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vstm5Q9D806 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vstm5Q9D806 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vstm5Q9D806 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vstm5Q9D806 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Vstm5Q9D806 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vstm5Q9D806 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vstm5Q9D806 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
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Vstm5Q9D806 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Vstm5Q9D806 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vstm5Q9D806 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vstm5Q9D806 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Vstm5Q9D806 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Vstm5Q9D806 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Vstm5Q9D806 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Vstm5Q9D806 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Vstm5Q9D806 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vstm5Q9D806 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Vstm5Q9D806 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vstm5Q9D806 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vstm5Q9D806 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vstm5Q9D806 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vstm5Q9D806 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Vstm5Q9D806 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Vstm5Q9D806 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vstm5Q9D806 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vstm5Q9D806 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vstm5Q9D806 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Vstm5Q9D806 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vstm5Q9D806 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vstm5Q9D806 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vstm5Q9D806 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vstm5Q9D806 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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