Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cldn22Q9D7U6 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cldn22Q9D7U6 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cldn22Q9D7U6 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cldn22Q9D7U6 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cldn22Q9D7U6 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cldn22Q9D7U6 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cldn22Q9D7U6 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cldn22Q9D7U6 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cldn22Q9D7U6 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cldn22Q9D7U6 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cldn22Q9D7U6 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cldn22Q9D7U6 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cldn22Q9D7U6 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cldn22Q9D7U6 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cldn22Q9D7U6 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cldn22Q9D7U6 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cldn22Q9D7U6 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cldn22Q9D7U6 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cldn22Q9D7U6 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cldn22Q9D7U6 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn22Q9D7U6 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn22Q9D7U6 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn22Q9D7U6 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn22Q9D7U6 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn22Q9D7U6 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn22Q9D7U6 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn22Q9D7U6 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn22Q9D7U6 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn22Q9D7U6 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn22Q9D7U6 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn22Q9D7U6 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn22Q9D7U6 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn22Q9D7U6 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn22Q9D7U6 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn22Q9D7U6 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn22Q9D7U6 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn22Q9D7U6 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn22Q9D7U6 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn22Q9D7U6 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn22Q9D7U6 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn22Q9D7U6 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn22Q9D7U6 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn22Q9D7U6 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn22Q9D7U6 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn22Q9D7U6 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn22Q9D7U6 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn22Q9D7U6 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn22Q9D7U6 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn22Q9D7U6 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn22Q9D7U6 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn22Q9D7U6 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn22Q9D7U6 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn22Q9D7U6 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn22Q9D7U6 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn22Q9D7U6 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn22Q9D7U6 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn22Q9D7U6 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn22Q9D7U6 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn22Q9D7U6 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn22Q9D7U6 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn22Q9D7U6 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn22Q9D7U6 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn22Q9D7U6 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn22Q9D7U6 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn22Q9D7U6 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn22Q9D7U6 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn22Q9D7U6 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn22Q9D7U6 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn22Q9D7U6 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn22Q9D7U6 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn22Q9D7U6 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn22Q9D7U6 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn22Q9D7U6 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn22Q9D7U6 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn22Q9D7U6 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn22Q9D7U6 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn22Q9D7U6 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn22Q9D7U6 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn22Q9D7U6 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn22Q9D7U6 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn22Q9D7U6 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn22Q9D7U6 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn22Q9D7U6 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn22Q9D7U6 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn22Q9D7U6 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn22Q9D7U6 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn22Q9D7U6 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn22Q9D7U6 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn22Q9D7U6 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn22Q9D7U6 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn22Q9D7U6 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn22Q9D7U6 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn22Q9D7U6 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn22Q9D7U6 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn22Q9D7U6 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn22Q9D7U6 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn22Q9D7U6 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn22Q9D7U6 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn22Q9D7U6 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms