Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S9

Chmp5, Charged multivesicular body protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp5Q9D7S9 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Chmp5Q9D7S9 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chmp5Q9D7S9 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chmp5Q9D7S9 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chmp5Q9D7S9 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chmp5Q9D7S9 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chmp5Q9D7S9 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chmp5Q9D7S9 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chmp5Q9D7S9 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chmp5Q9D7S9 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chmp5Q9D7S9 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chmp5Q9D7S9 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chmp5Q9D7S9 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chmp5Q9D7S9 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chmp5Q9D7S9 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chmp5Q9D7S9 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chmp5Q9D7S9 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chmp5Q9D7S9 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chmp5Q9D7S9 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chmp5Q9D7S9 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chmp5Q9D7S9 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chmp5Q9D7S9 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chmp5Q9D7S9 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chmp5Q9D7S9 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chmp5Q9D7S9 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chmp5Q9D7S9 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chmp5Q9D7S9 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chmp5Q9D7S9 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chmp5Q9D7S9 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chmp5Q9D7S9 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chmp5Q9D7S9 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chmp5Q9D7S9 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chmp5Q9D7S9 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Chmp5Q9D7S9 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chmp5Q9D7S9 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chmp5Q9D7S9 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chmp5Q9D7S9 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chmp5Q9D7S9 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chmp5Q9D7S9 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chmp5Q9D7S9 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chmp5Q9D7S9 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chmp5Q9D7S9 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chmp5Q9D7S9 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Chmp5Q9D7S9 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Chmp5Q9D7S9 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Chmp5Q9D7S9 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chmp5Q9D7S9 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chmp5Q9D7S9 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chmp5Q9D7S9 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Chmp5Q9D7S9 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chmp5Q9D7S9 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chmp5Q9D7S9 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Chmp5Q9D7S9 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chmp5Q9D7S9 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chmp5Q9D7S9 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chmp5Q9D7S9 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chmp5Q9D7S9 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chmp5Q9D7S9 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chmp5Q9D7S9 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chmp5Q9D7S9 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chmp5Q9D7S9 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chmp5Q9D7S9 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chmp5Q9D7S9 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chmp5Q9D7S9 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chmp5Q9D7S9 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chmp5Q9D7S9 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chmp5Q9D7S9 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chmp5Q9D7S9 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chmp5Q9D7S9 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chmp5Q9D7S9 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chmp5Q9D7S9 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chmp5Q9D7S9 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chmp5Q9D7S9 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chmp5Q9D7S9 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Chmp5Q9D7S9 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chmp5Q9D7S9 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chmp5Q9D7S9 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chmp5Q9D7S9 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chmp5Q9D7S9 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chmp5Q9D7S9 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chmp5Q9D7S9 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chmp5Q9D7S9 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chmp5Q9D7S9 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chmp5Q9D7S9 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chmp5Q9D7S9 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chmp5Q9D7S9 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chmp5Q9D7S9 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chmp5Q9D7S9 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chmp5Q9D7S9 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chmp5Q9D7S9 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chmp5Q9D7S9 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chmp5Q9D7S9 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chmp5Q9D7S9 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chmp5Q9D7S9 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chmp5Q9D7S9 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chmp5Q9D7S9 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chmp5Q9D7S9 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chmp5Q9D7S9 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chmp5Q9D7S9 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chmp5Q9D7S9 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms