Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S1

Tmem54, Transmembrane protein 54, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Tmem54Q9D7S1 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Tmem54Q9D7S1 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmem54Q9D7S1 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmem54Q9D7S1 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmem54Q9D7S1 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Tmem54Q9D7S1 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Tmem54Q9D7S1 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmem54Q9D7S1 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmem54Q9D7S1 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmem54Q9D7S1 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmem54Q9D7S1 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmem54Q9D7S1 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmem54Q9D7S1 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmem54Q9D7S1 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmem54Q9D7S1 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmem54Q9D7S1 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmem54Q9D7S1 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmem54Q9D7S1 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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