Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7I0

Shisa5, Protein shisa-5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa5Q9D7I0 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms