Protein–RNA interactions for Protein: Q9D701

Upk3bl1, Uroplakin-3b-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3bl1Q9D701 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Upk3bl1Q9D701 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Upk3bl1Q9D701 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Upk3bl1Q9D701 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Upk3bl1Q9D701 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Upk3bl1Q9D701 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Upk3bl1Q9D701 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Upk3bl1Q9D701 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upk3bl1Q9D701 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upk3bl1Q9D701 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upk3bl1Q9D701 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upk3bl1Q9D701 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upk3bl1Q9D701 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upk3bl1Q9D701 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upk3bl1Q9D701 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upk3bl1Q9D701 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upk3bl1Q9D701 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upk3bl1Q9D701 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upk3bl1Q9D701 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Upk3bl1Q9D701 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upk3bl1Q9D701 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Upk3bl1Q9D701 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upk3bl1Q9D701 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upk3bl1Q9D701 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upk3bl1Q9D701 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upk3bl1Q9D701 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upk3bl1Q9D701 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Upk3bl1Q9D701 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upk3bl1Q9D701 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upk3bl1Q9D701 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upk3bl1Q9D701 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upk3bl1Q9D701 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upk3bl1Q9D701 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upk3bl1Q9D701 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Upk3bl1Q9D701 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Upk3bl1Q9D701 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Upk3bl1Q9D701 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Upk3bl1Q9D701 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Upk3bl1Q9D701 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms