Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y9

Gbe1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbe1Q9D6Y9 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Gbe1Q9D6Y9 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gbe1Q9D6Y9 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gbe1Q9D6Y9 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gbe1Q9D6Y9 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gbe1Q9D6Y9 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gbe1Q9D6Y9 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gbe1Q9D6Y9 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gbe1Q9D6Y9 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Gbe1Q9D6Y9 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gbe1Q9D6Y9 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gbe1Q9D6Y9 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gbe1Q9D6Y9 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Gbe1Q9D6Y9 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gbe1Q9D6Y9 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gbe1Q9D6Y9 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Gbe1Q9D6Y9 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gbe1Q9D6Y9 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gbe1Q9D6Y9 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gbe1Q9D6Y9 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gbe1Q9D6Y9 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gbe1Q9D6Y9 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gbe1Q9D6Y9 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gbe1Q9D6Y9 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gbe1Q9D6Y9 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gbe1Q9D6Y9 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gbe1Q9D6Y9 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gbe1Q9D6Y9 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gbe1Q9D6Y9 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gbe1Q9D6Y9 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gbe1Q9D6Y9 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gbe1Q9D6Y9 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gbe1Q9D6Y9 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gbe1Q9D6Y9 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gbe1Q9D6Y9 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gbe1Q9D6Y9 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gbe1Q9D6Y9 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gbe1Q9D6Y9 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gbe1Q9D6Y9 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gbe1Q9D6Y9 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gbe1Q9D6Y9 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms