Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6N1

Ca13, Carbonic anhydrase 13, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ca13Q9D6N1 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ca13Q9D6N1 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ca13Q9D6N1 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ca13Q9D6N1 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ca13Q9D6N1 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ca13Q9D6N1 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ca13Q9D6N1 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ca13Q9D6N1 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ca13Q9D6N1 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ca13Q9D6N1 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ca13Q9D6N1 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ca13Q9D6N1 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ca13Q9D6N1 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ca13Q9D6N1 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ca13Q9D6N1 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ca13Q9D6N1 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ca13Q9D6N1 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ca13Q9D6N1 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ca13Q9D6N1 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ca13Q9D6N1 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ca13Q9D6N1 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ca13Q9D6N1 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ca13Q9D6N1 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ca13Q9D6N1 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ca13Q9D6N1 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ca13Q9D6N1 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ca13Q9D6N1 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ca13Q9D6N1 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ca13Q9D6N1 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ca13Q9D6N1 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ca13Q9D6N1 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ca13Q9D6N1 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ca13Q9D6N1 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ca13Q9D6N1 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ca13Q9D6N1 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ca13Q9D6N1 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ca13Q9D6N1 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ca13Q9D6N1 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ca13Q9D6N1 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ca13Q9D6N1 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ca13Q9D6N1 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ca13Q9D6N1 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ca13Q9D6N1 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ca13Q9D6N1 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ca13Q9D6N1 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ca13Q9D6N1 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ca13Q9D6N1 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ca13Q9D6N1 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ca13Q9D6N1 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ca13Q9D6N1 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ca13Q9D6N1 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ca13Q9D6N1 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ca13Q9D6N1 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ca13Q9D6N1 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ca13Q9D6N1 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ca13Q9D6N1 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ca13Q9D6N1 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ca13Q9D6N1 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ca13Q9D6N1 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ca13Q9D6N1 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ca13Q9D6N1 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ca13Q9D6N1 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ca13Q9D6N1 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ca13Q9D6N1 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ca13Q9D6N1 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ca13Q9D6N1 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ca13Q9D6N1 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ca13Q9D6N1 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ca13Q9D6N1 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ca13Q9D6N1 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ca13Q9D6N1 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ca13Q9D6N1 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ca13Q9D6N1 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ca13Q9D6N1 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ca13Q9D6N1 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ca13Q9D6N1 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ca13Q9D6N1 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ca13Q9D6N1 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ca13Q9D6N1 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ca13Q9D6N1 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ca13Q9D6N1 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ca13Q9D6N1 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ca13Q9D6N1 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ca13Q9D6N1 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ca13Q9D6N1 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ca13Q9D6N1 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ca13Q9D6N1 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ca13Q9D6N1 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ca13Q9D6N1 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ca13Q9D6N1 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ca13Q9D6N1 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ca13Q9D6N1 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ca13Q9D6N1 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ca13Q9D6N1 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ca13Q9D6N1 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ca13Q9D6N1 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ca13Q9D6N1 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ca13Q9D6N1 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ca13Q9D6N1 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ca13Q9D6N1 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms