Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J4

Necab3, N-terminal EF-hand calcium-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Necab3Q9D6J4 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Necab3Q9D6J4 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Necab3Q9D6J4 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Necab3Q9D6J4 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Necab3Q9D6J4 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Necab3Q9D6J4 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Necab3Q9D6J4 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Necab3Q9D6J4 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Necab3Q9D6J4 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Necab3Q9D6J4 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Necab3Q9D6J4 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Necab3Q9D6J4 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Necab3Q9D6J4 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Necab3Q9D6J4 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Necab3Q9D6J4 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Necab3Q9D6J4 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Necab3Q9D6J4 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Necab3Q9D6J4 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Necab3Q9D6J4 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Necab3Q9D6J4 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Necab3Q9D6J4 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Necab3Q9D6J4 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Necab3Q9D6J4 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Necab3Q9D6J4 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Necab3Q9D6J4 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Necab3Q9D6J4 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Necab3Q9D6J4 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Necab3Q9D6J4 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Necab3Q9D6J4 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Necab3Q9D6J4 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Necab3Q9D6J4 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Necab3Q9D6J4 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Necab3Q9D6J4 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Necab3Q9D6J4 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Necab3Q9D6J4 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Necab3Q9D6J4 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Necab3Q9D6J4 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Necab3Q9D6J4 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Necab3Q9D6J4 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Necab3Q9D6J4 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Necab3Q9D6J4 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Necab3Q9D6J4 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Necab3Q9D6J4 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Necab3Q9D6J4 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Necab3Q9D6J4 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Necab3Q9D6J4 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Necab3Q9D6J4 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Necab3Q9D6J4 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Necab3Q9D6J4 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Necab3Q9D6J4 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Necab3Q9D6J4 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Necab3Q9D6J4 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Necab3Q9D6J4 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Necab3Q9D6J4 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Necab3Q9D6J4 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Necab3Q9D6J4 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Necab3Q9D6J4 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Necab3Q9D6J4 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Necab3Q9D6J4 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Necab3Q9D6J4 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Necab3Q9D6J4 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Necab3Q9D6J4 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Necab3Q9D6J4 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Necab3Q9D6J4 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Necab3Q9D6J4 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Necab3Q9D6J4 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Necab3Q9D6J4 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Necab3Q9D6J4 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Necab3Q9D6J4 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Necab3Q9D6J4 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Necab3Q9D6J4 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Necab3Q9D6J4 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Necab3Q9D6J4 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Necab3Q9D6J4 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Necab3Q9D6J4 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Necab3Q9D6J4 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Necab3Q9D6J4 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Necab3Q9D6J4 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Necab3Q9D6J4 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Necab3Q9D6J4 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Necab3Q9D6J4 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Necab3Q9D6J4 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Necab3Q9D6J4 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Necab3Q9D6J4 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Necab3Q9D6J4 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Necab3Q9D6J4 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Necab3Q9D6J4 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Necab3Q9D6J4 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Necab3Q9D6J4 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Necab3Q9D6J4 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Necab3Q9D6J4 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Necab3Q9D6J4 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Necab3Q9D6J4 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Necab3Q9D6J4 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Necab3Q9D6J4 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Necab3Q9D6J4 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Necab3Q9D6J4 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Necab3Q9D6J4 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Necab3Q9D6J4 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Necab3Q9D6J4 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms