Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U0

Lpcat2b, Lysophosphatidylcholine acyltransferase 2B, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lpcat2bQ9D5U0 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lpcat2bQ9D5U0 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lpcat2bQ9D5U0 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lpcat2bQ9D5U0 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lpcat2bQ9D5U0 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lpcat2bQ9D5U0 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lpcat2bQ9D5U0 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lpcat2bQ9D5U0 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lpcat2bQ9D5U0 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lpcat2bQ9D5U0 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lpcat2bQ9D5U0 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lpcat2bQ9D5U0 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lpcat2bQ9D5U0 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lpcat2bQ9D5U0 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lpcat2bQ9D5U0 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lpcat2bQ9D5U0 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lpcat2bQ9D5U0 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lpcat2bQ9D5U0 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lpcat2bQ9D5U0 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lpcat2bQ9D5U0 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lpcat2bQ9D5U0 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lpcat2bQ9D5U0 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lpcat2bQ9D5U0 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lpcat2bQ9D5U0 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lpcat2bQ9D5U0 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lpcat2bQ9D5U0 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lpcat2bQ9D5U0 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lpcat2bQ9D5U0 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lpcat2bQ9D5U0 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lpcat2bQ9D5U0 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lpcat2bQ9D5U0 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lpcat2bQ9D5U0 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lpcat2bQ9D5U0 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lpcat2bQ9D5U0 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lpcat2bQ9D5U0 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lpcat2bQ9D5U0 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lpcat2bQ9D5U0 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lpcat2bQ9D5U0 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lpcat2bQ9D5U0 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lpcat2bQ9D5U0 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lpcat2bQ9D5U0 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lpcat2bQ9D5U0 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lpcat2bQ9D5U0 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lpcat2bQ9D5U0 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lpcat2bQ9D5U0 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lpcat2bQ9D5U0 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lpcat2bQ9D5U0 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lpcat2bQ9D5U0 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lpcat2bQ9D5U0 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lpcat2bQ9D5U0 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lpcat2bQ9D5U0 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lpcat2bQ9D5U0 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lpcat2bQ9D5U0 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lpcat2bQ9D5U0 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lpcat2bQ9D5U0 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lpcat2bQ9D5U0 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lpcat2bQ9D5U0 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lpcat2bQ9D5U0 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lpcat2bQ9D5U0 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lpcat2bQ9D5U0 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lpcat2bQ9D5U0 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lpcat2bQ9D5U0 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lpcat2bQ9D5U0 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lpcat2bQ9D5U0 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lpcat2bQ9D5U0 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lpcat2bQ9D5U0 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lpcat2bQ9D5U0 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lpcat2bQ9D5U0 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lpcat2bQ9D5U0 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lpcat2bQ9D5U0 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lpcat2bQ9D5U0 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lpcat2bQ9D5U0 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lpcat2bQ9D5U0 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lpcat2bQ9D5U0 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lpcat2bQ9D5U0 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lpcat2bQ9D5U0 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lpcat2bQ9D5U0 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lpcat2bQ9D5U0 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lpcat2bQ9D5U0 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lpcat2bQ9D5U0 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lpcat2bQ9D5U0 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lpcat2bQ9D5U0 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lpcat2bQ9D5U0 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lpcat2bQ9D5U0 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lpcat2bQ9D5U0 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lpcat2bQ9D5U0 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lpcat2bQ9D5U0 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Lpcat2bQ9D5U0 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lpcat2bQ9D5U0 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lpcat2bQ9D5U0 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lpcat2bQ9D5U0 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lpcat2bQ9D5U0 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lpcat2bQ9D5U0 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lpcat2bQ9D5U0 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lpcat2bQ9D5U0 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lpcat2bQ9D5U0 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lpcat2bQ9D5U0 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lpcat2bQ9D5U0 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lpcat2bQ9D5U0 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lpcat2bQ9D5U0 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms