Protein–RNA interactions for Protein: Q9D506

Gm3404, Predicted gene 3404, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3404Q9D506 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3404Q9D506 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3404Q9D506 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3404Q9D506 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3404Q9D506 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3404Q9D506 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3404Q9D506 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3404Q9D506 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3404Q9D506 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3404Q9D506 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3404Q9D506 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3404Q9D506 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3404Q9D506 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3404Q9D506 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3404Q9D506 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3404Q9D506 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3404Q9D506 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3404Q9D506 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3404Q9D506 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3404Q9D506 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3404Q9D506 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3404Q9D506 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3404Q9D506 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3404Q9D506 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3404Q9D506 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm3404Q9D506 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm3404Q9D506 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm3404Q9D506 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm3404Q9D506 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm3404Q9D506 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm3404Q9D506 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm3404Q9D506 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm3404Q9D506 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm3404Q9D506 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm3404Q9D506 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm3404Q9D506 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm3404Q9D506 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm3404Q9D506 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm3404Q9D506 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm3404Q9D506 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm3404Q9D506 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm3404Q9D506 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm3404Q9D506 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm3404Q9D506 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm3404Q9D506 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm3404Q9D506 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm3404Q9D506 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm3404Q9D506 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm3404Q9D506 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm3404Q9D506 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm3404Q9D506 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm3404Q9D506 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm3404Q9D506 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm3404Q9D506 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm3404Q9D506 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm3404Q9D506 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm3404Q9D506 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm3404Q9D506 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm3404Q9D506 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm3404Q9D506 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm3404Q9D506 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm3404Q9D506 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm3404Q9D506 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm3404Q9D506 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm3404Q9D506 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Gm3404Q9D506 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gm3404Q9D506 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gm3404Q9D506 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm3404Q9D506 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm3404Q9D506 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm3404Q9D506 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm3404Q9D506 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm3404Q9D506 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm3404Q9D506 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm3404Q9D506 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm3404Q9D506 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm3404Q9D506 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm3404Q9D506 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm3404Q9D506 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm3404Q9D506 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm3404Q9D506 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm3404Q9D506 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3404Q9D506 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3404Q9D506 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3404Q9D506 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3404Q9D506 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3404Q9D506 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3404Q9D506 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3404Q9D506 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3404Q9D506 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3404Q9D506 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3404Q9D506 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3404Q9D506 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3404Q9D506 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3404Q9D506 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3404Q9D506 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3404Q9D506 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3404Q9D506 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3404Q9D506 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3404Q9D506 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms