Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrameQ9D4Z5 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrameQ9D4Z5 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrameQ9D4Z5 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrameQ9D4Z5 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrameQ9D4Z5 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrameQ9D4Z5 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrameQ9D4Z5 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrameQ9D4Z5 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PrameQ9D4Z5 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrameQ9D4Z5 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrameQ9D4Z5 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrameQ9D4Z5 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrameQ9D4Z5 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrameQ9D4Z5 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrameQ9D4Z5 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrameQ9D4Z5 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrameQ9D4Z5 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrameQ9D4Z5 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrameQ9D4Z5 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrameQ9D4Z5 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrameQ9D4Z5 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrameQ9D4Z5 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrameQ9D4Z5 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrameQ9D4Z5 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrameQ9D4Z5 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrameQ9D4Z5 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrameQ9D4Z5 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrameQ9D4Z5 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrameQ9D4Z5 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrameQ9D4Z5 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrameQ9D4Z5 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrameQ9D4Z5 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrameQ9D4Z5 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrameQ9D4Z5 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrameQ9D4Z5 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrameQ9D4Z5 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrameQ9D4Z5 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrameQ9D4Z5 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrameQ9D4Z5 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrameQ9D4Z5 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrameQ9D4Z5 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrameQ9D4Z5 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrameQ9D4Z5 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrameQ9D4Z5 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrameQ9D4Z5 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrameQ9D4Z5 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrameQ9D4Z5 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PrameQ9D4Z5 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrameQ9D4Z5 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrameQ9D4Z5 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrameQ9D4Z5 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrameQ9D4Z5 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrameQ9D4Z5 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PrameQ9D4Z5 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PrameQ9D4Z5 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrameQ9D4Z5 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrameQ9D4Z5 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrameQ9D4Z5 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrameQ9D4Z5 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrameQ9D4Z5 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrameQ9D4Z5 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrameQ9D4Z5 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrameQ9D4Z5 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrameQ9D4Z5 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrameQ9D4Z5 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrameQ9D4Z5 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrameQ9D4Z5 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrameQ9D4Z5 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrameQ9D4Z5 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrameQ9D4Z5 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrameQ9D4Z5 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrameQ9D4Z5 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrameQ9D4Z5 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrameQ9D4Z5 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrameQ9D4Z5 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrameQ9D4Z5 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrameQ9D4Z5 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrameQ9D4Z5 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrameQ9D4Z5 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PrameQ9D4Z5 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PrameQ9D4Z5 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrameQ9D4Z5 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrameQ9D4Z5 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrameQ9D4Z5 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrameQ9D4Z5 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrameQ9D4Z5 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrameQ9D4Z5 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrameQ9D4Z5 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrameQ9D4Z5 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrameQ9D4Z5 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PrameQ9D4Z5 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrameQ9D4Z5 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrameQ9D4Z5 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrameQ9D4Z5 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrameQ9D4Z5 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrameQ9D4Z5 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrameQ9D4Z5 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrameQ9D4Z5 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrameQ9D4Z5 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms