Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J9

4931423N10Rik, MCG52616, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931423N10RikQ9D4J9 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
4931423N10RikQ9D4J9 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4931423N10RikQ9D4J9 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4931423N10RikQ9D4J9 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4931423N10RikQ9D4J9 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4931423N10RikQ9D4J9 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
4931423N10RikQ9D4J9 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4931423N10RikQ9D4J9 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4931423N10RikQ9D4J9 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4931423N10RikQ9D4J9 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4931423N10RikQ9D4J9 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4931423N10RikQ9D4J9 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4931423N10RikQ9D4J9 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
4931423N10RikQ9D4J9 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4931423N10RikQ9D4J9 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4931423N10RikQ9D4J9 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
4931423N10RikQ9D4J9 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4931423N10RikQ9D4J9 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4931423N10RikQ9D4J9 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4931423N10RikQ9D4J9 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
4931423N10RikQ9D4J9 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4931423N10RikQ9D4J9 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
4931423N10RikQ9D4J9 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
4931423N10RikQ9D4J9 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4931423N10RikQ9D4J9 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4931423N10RikQ9D4J9 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4931423N10RikQ9D4J9 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4931423N10RikQ9D4J9 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4931423N10RikQ9D4J9 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
4931423N10RikQ9D4J9 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4931423N10RikQ9D4J9 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4931423N10RikQ9D4J9 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4931423N10RikQ9D4J9 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4931423N10RikQ9D4J9 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4931423N10RikQ9D4J9 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4931423N10RikQ9D4J9 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
4931423N10RikQ9D4J9 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
4931423N10RikQ9D4J9 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
4931423N10RikQ9D4J9 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4931423N10RikQ9D4J9 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
4931423N10RikQ9D4J9 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4931423N10RikQ9D4J9 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4931423N10RikQ9D4J9 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4931423N10RikQ9D4J9 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4931423N10RikQ9D4J9 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4931423N10RikQ9D4J9 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
4931423N10RikQ9D4J9 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4931423N10RikQ9D4J9 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4931423N10RikQ9D4J9 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4931423N10RikQ9D4J9 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
4931423N10RikQ9D4J9 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4931423N10RikQ9D4J9 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
4931423N10RikQ9D4J9 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
4931423N10RikQ9D4J9 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4931423N10RikQ9D4J9 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4931423N10RikQ9D4J9 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4931423N10RikQ9D4J9 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
4931423N10RikQ9D4J9 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
4931423N10RikQ9D4J9 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4931423N10RikQ9D4J9 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
4931423N10RikQ9D4J9 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4931423N10RikQ9D4J9 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
4931423N10RikQ9D4J9 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4931423N10RikQ9D4J9 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4931423N10RikQ9D4J9 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
4931423N10RikQ9D4J9 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
4931423N10RikQ9D4J9 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4931423N10RikQ9D4J9 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4931423N10RikQ9D4J9 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4931423N10RikQ9D4J9 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4931423N10RikQ9D4J9 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4931423N10RikQ9D4J9 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4931423N10RikQ9D4J9 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4931423N10RikQ9D4J9 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4931423N10RikQ9D4J9 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4931423N10RikQ9D4J9 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4931423N10RikQ9D4J9 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4931423N10RikQ9D4J9 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4931423N10RikQ9D4J9 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4931423N10RikQ9D4J9 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
4931423N10RikQ9D4J9 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
4931423N10RikQ9D4J9 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
4931423N10RikQ9D4J9 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
4931423N10RikQ9D4J9 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
4931423N10RikQ9D4J9 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
4931423N10RikQ9D4J9 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
4931423N10RikQ9D4J9 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
4931423N10RikQ9D4J9 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
4931423N10RikQ9D4J9 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
4931423N10RikQ9D4J9 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
4931423N10RikQ9D4J9 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
4931423N10RikQ9D4J9 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
4931423N10RikQ9D4J9 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
4931423N10RikQ9D4J9 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
4931423N10RikQ9D4J9 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
4931423N10RikQ9D4J9 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
4931423N10RikQ9D4J9 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
4931423N10RikQ9D4J9 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
4931423N10RikQ9D4J9 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
4931423N10RikQ9D4J9 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms