Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F3

Fam90a1b, Family with sequence similarity 90, member A1B, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam90a1bQ9D4F3 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam90a1bQ9D4F3 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam90a1bQ9D4F3 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam90a1bQ9D4F3 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam90a1bQ9D4F3 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam90a1bQ9D4F3 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam90a1bQ9D4F3 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Fam90a1bQ9D4F3 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam90a1bQ9D4F3 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam90a1bQ9D4F3 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam90a1bQ9D4F3 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam90a1bQ9D4F3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam90a1bQ9D4F3 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam90a1bQ9D4F3 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam90a1bQ9D4F3 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam90a1bQ9D4F3 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam90a1bQ9D4F3 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam90a1bQ9D4F3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam90a1bQ9D4F3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam90a1bQ9D4F3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam90a1bQ9D4F3 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam90a1bQ9D4F3 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam90a1bQ9D4F3 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam90a1bQ9D4F3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam90a1bQ9D4F3 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam90a1bQ9D4F3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam90a1bQ9D4F3 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam90a1bQ9D4F3 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam90a1bQ9D4F3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam90a1bQ9D4F3 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam90a1bQ9D4F3 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam90a1bQ9D4F3 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam90a1bQ9D4F3 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam90a1bQ9D4F3 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam90a1bQ9D4F3 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam90a1bQ9D4F3 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam90a1bQ9D4F3 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam90a1bQ9D4F3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam90a1bQ9D4F3 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam90a1bQ9D4F3 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam90a1bQ9D4F3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam90a1bQ9D4F3 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam90a1bQ9D4F3 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam90a1bQ9D4F3 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam90a1bQ9D4F3 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam90a1bQ9D4F3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam90a1bQ9D4F3 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam90a1bQ9D4F3 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam90a1bQ9D4F3 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam90a1bQ9D4F3 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam90a1bQ9D4F3 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam90a1bQ9D4F3 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam90a1bQ9D4F3 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam90a1bQ9D4F3 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam90a1bQ9D4F3 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam90a1bQ9D4F3 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam90a1bQ9D4F3 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam90a1bQ9D4F3 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam90a1bQ9D4F3 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam90a1bQ9D4F3 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam90a1bQ9D4F3 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam90a1bQ9D4F3 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam90a1bQ9D4F3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam90a1bQ9D4F3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam90a1bQ9D4F3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam90a1bQ9D4F3 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam90a1bQ9D4F3 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam90a1bQ9D4F3 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam90a1bQ9D4F3 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam90a1bQ9D4F3 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam90a1bQ9D4F3 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam90a1bQ9D4F3 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam90a1bQ9D4F3 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam90a1bQ9D4F3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam90a1bQ9D4F3 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam90a1bQ9D4F3 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam90a1bQ9D4F3 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam90a1bQ9D4F3 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam90a1bQ9D4F3 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam90a1bQ9D4F3 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam90a1bQ9D4F3 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam90a1bQ9D4F3 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam90a1bQ9D4F3 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam90a1bQ9D4F3 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam90a1bQ9D4F3 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam90a1bQ9D4F3 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam90a1bQ9D4F3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam90a1bQ9D4F3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam90a1bQ9D4F3 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam90a1bQ9D4F3 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam90a1bQ9D4F3 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam90a1bQ9D4F3 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam90a1bQ9D4F3 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam90a1bQ9D4F3 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam90a1bQ9D4F3 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam90a1bQ9D4F3 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam90a1bQ9D4F3 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam90a1bQ9D4F3 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam90a1bQ9D4F3 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam90a1bQ9D4F3 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms