Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C9

Clvs1, Clavesin-1, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clvs1Q9D4C9 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clvs1Q9D4C9 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clvs1Q9D4C9 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clvs1Q9D4C9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clvs1Q9D4C9 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clvs1Q9D4C9 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clvs1Q9D4C9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Clvs1Q9D4C9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clvs1Q9D4C9 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clvs1Q9D4C9 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clvs1Q9D4C9 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clvs1Q9D4C9 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clvs1Q9D4C9 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clvs1Q9D4C9 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clvs1Q9D4C9 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clvs1Q9D4C9 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clvs1Q9D4C9 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clvs1Q9D4C9 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clvs1Q9D4C9 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clvs1Q9D4C9 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clvs1Q9D4C9 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clvs1Q9D4C9 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clvs1Q9D4C9 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clvs1Q9D4C9 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clvs1Q9D4C9 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clvs1Q9D4C9 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clvs1Q9D4C9 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clvs1Q9D4C9 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clvs1Q9D4C9 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clvs1Q9D4C9 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clvs1Q9D4C9 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clvs1Q9D4C9 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clvs1Q9D4C9 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clvs1Q9D4C9 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clvs1Q9D4C9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clvs1Q9D4C9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clvs1Q9D4C9 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clvs1Q9D4C9 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clvs1Q9D4C9 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clvs1Q9D4C9 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clvs1Q9D4C9 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clvs1Q9D4C9 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clvs1Q9D4C9 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clvs1Q9D4C9 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clvs1Q9D4C9 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clvs1Q9D4C9 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clvs1Q9D4C9 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clvs1Q9D4C9 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clvs1Q9D4C9 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clvs1Q9D4C9 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clvs1Q9D4C9 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clvs1Q9D4C9 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clvs1Q9D4C9 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clvs1Q9D4C9 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clvs1Q9D4C9 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clvs1Q9D4C9 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clvs1Q9D4C9 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clvs1Q9D4C9 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clvs1Q9D4C9 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clvs1Q9D4C9 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clvs1Q9D4C9 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clvs1Q9D4C9 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clvs1Q9D4C9 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clvs1Q9D4C9 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clvs1Q9D4C9 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clvs1Q9D4C9 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clvs1Q9D4C9 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clvs1Q9D4C9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clvs1Q9D4C9 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clvs1Q9D4C9 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clvs1Q9D4C9 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clvs1Q9D4C9 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clvs1Q9D4C9 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clvs1Q9D4C9 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clvs1Q9D4C9 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clvs1Q9D4C9 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clvs1Q9D4C9 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clvs1Q9D4C9 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clvs1Q9D4C9 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clvs1Q9D4C9 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clvs1Q9D4C9 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clvs1Q9D4C9 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clvs1Q9D4C9 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clvs1Q9D4C9 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clvs1Q9D4C9 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clvs1Q9D4C9 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clvs1Q9D4C9 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clvs1Q9D4C9 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clvs1Q9D4C9 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clvs1Q9D4C9 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clvs1Q9D4C9 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clvs1Q9D4C9 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clvs1Q9D4C9 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clvs1Q9D4C9 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clvs1Q9D4C9 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clvs1Q9D4C9 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clvs1Q9D4C9 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clvs1Q9D4C9 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clvs1Q9D4C9 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clvs1Q9D4C9 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms