Protein–RNA interactions for Protein: Q9D485

Efhc2, EF-hand domain-containing family member C2, mousemouse

Predictions only

Length 750 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhc2Q9D485 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Efhc2Q9D485 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Efhc2Q9D485 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Efhc2Q9D485 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Efhc2Q9D485 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Efhc2Q9D485 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Efhc2Q9D485 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Efhc2Q9D485 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Efhc2Q9D485 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Efhc2Q9D485 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Efhc2Q9D485 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Efhc2Q9D485 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Efhc2Q9D485 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Efhc2Q9D485 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Efhc2Q9D485 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Efhc2Q9D485 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Efhc2Q9D485 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Efhc2Q9D485 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Efhc2Q9D485 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Efhc2Q9D485 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Efhc2Q9D485 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Efhc2Q9D485 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Efhc2Q9D485 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Efhc2Q9D485 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Efhc2Q9D485 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Efhc2Q9D485 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Efhc2Q9D485 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Efhc2Q9D485 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Efhc2Q9D485 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Efhc2Q9D485 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Efhc2Q9D485 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Efhc2Q9D485 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Efhc2Q9D485 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Efhc2Q9D485 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Efhc2Q9D485 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Efhc2Q9D485 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Efhc2Q9D485 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Efhc2Q9D485 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Efhc2Q9D485 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Efhc2Q9D485 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Efhc2Q9D485 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Efhc2Q9D485 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Efhc2Q9D485 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Efhc2Q9D485 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Efhc2Q9D485 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Efhc2Q9D485 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Efhc2Q9D485 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Efhc2Q9D485 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Efhc2Q9D485 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Efhc2Q9D485 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Efhc2Q9D485 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Efhc2Q9D485 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Efhc2Q9D485 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Efhc2Q9D485 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Efhc2Q9D485 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Efhc2Q9D485 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Efhc2Q9D485 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Efhc2Q9D485 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Efhc2Q9D485 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Efhc2Q9D485 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Efhc2Q9D485 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Efhc2Q9D485 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Efhc2Q9D485 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Efhc2Q9D485 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Efhc2Q9D485 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Efhc2Q9D485 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Efhc2Q9D485 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Efhc2Q9D485 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Efhc2Q9D485 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Efhc2Q9D485 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Efhc2Q9D485 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Efhc2Q9D485 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Efhc2Q9D485 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Efhc2Q9D485 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Efhc2Q9D485 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Efhc2Q9D485 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Efhc2Q9D485 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Efhc2Q9D485 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Efhc2Q9D485 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Efhc2Q9D485 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Efhc2Q9D485 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Efhc2Q9D485 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Efhc2Q9D485 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Efhc2Q9D485 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Efhc2Q9D485 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Efhc2Q9D485 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Efhc2Q9D485 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Efhc2Q9D485 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Efhc2Q9D485 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Efhc2Q9D485 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Efhc2Q9D485 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Efhc2Q9D485 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Efhc2Q9D485 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Efhc2Q9D485 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Efhc2Q9D485 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Efhc2Q9D485 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Efhc2Q9D485 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Efhc2Q9D485 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Efhc2Q9D485 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Efhc2Q9D485 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms