Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W1

Rsph14, Radial spoke head 14 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph14Q9D3W1 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rsph14Q9D3W1 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rsph14Q9D3W1 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rsph14Q9D3W1 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rsph14Q9D3W1 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rsph14Q9D3W1 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rsph14Q9D3W1 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rsph14Q9D3W1 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rsph14Q9D3W1 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rsph14Q9D3W1 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rsph14Q9D3W1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rsph14Q9D3W1 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rsph14Q9D3W1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rsph14Q9D3W1 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rsph14Q9D3W1 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rsph14Q9D3W1 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rsph14Q9D3W1 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rsph14Q9D3W1 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rsph14Q9D3W1 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rsph14Q9D3W1 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rsph14Q9D3W1 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rsph14Q9D3W1 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rsph14Q9D3W1 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rsph14Q9D3W1 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rsph14Q9D3W1 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rsph14Q9D3W1 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rsph14Q9D3W1 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rsph14Q9D3W1 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rsph14Q9D3W1 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rsph14Q9D3W1 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rsph14Q9D3W1 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rsph14Q9D3W1 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rsph14Q9D3W1 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rsph14Q9D3W1 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rsph14Q9D3W1 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rsph14Q9D3W1 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rsph14Q9D3W1 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rsph14Q9D3W1 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rsph14Q9D3W1 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rsph14Q9D3W1 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rsph14Q9D3W1 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rsph14Q9D3W1 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rsph14Q9D3W1 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rsph14Q9D3W1 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rsph14Q9D3W1 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rsph14Q9D3W1 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rsph14Q9D3W1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rsph14Q9D3W1 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rsph14Q9D3W1 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rsph14Q9D3W1 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rsph14Q9D3W1 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rsph14Q9D3W1 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rsph14Q9D3W1 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rsph14Q9D3W1 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rsph14Q9D3W1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rsph14Q9D3W1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rsph14Q9D3W1 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rsph14Q9D3W1 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rsph14Q9D3W1 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rsph14Q9D3W1 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rsph14Q9D3W1 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rsph14Q9D3W1 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rsph14Q9D3W1 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms