Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3R6

Katnal2, Katanin p60 ATPase-containing subunit A-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Katnal2Q9D3R6 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Katnal2Q9D3R6 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Katnal2Q9D3R6 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Katnal2Q9D3R6 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Katnal2Q9D3R6 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Katnal2Q9D3R6 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Katnal2Q9D3R6 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Katnal2Q9D3R6 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Katnal2Q9D3R6 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Katnal2Q9D3R6 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Katnal2Q9D3R6 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Katnal2Q9D3R6 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Katnal2Q9D3R6 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Katnal2Q9D3R6 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Katnal2Q9D3R6 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Katnal2Q9D3R6 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Katnal2Q9D3R6 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Katnal2Q9D3R6 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Katnal2Q9D3R6 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Katnal2Q9D3R6 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Katnal2Q9D3R6 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Katnal2Q9D3R6 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Katnal2Q9D3R6 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Katnal2Q9D3R6 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Katnal2Q9D3R6 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Katnal2Q9D3R6 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Katnal2Q9D3R6 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Katnal2Q9D3R6 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Katnal2Q9D3R6 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Katnal2Q9D3R6 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Katnal2Q9D3R6 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Katnal2Q9D3R6 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Katnal2Q9D3R6 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Katnal2Q9D3R6 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Katnal2Q9D3R6 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Katnal2Q9D3R6 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Katnal2Q9D3R6 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Katnal2Q9D3R6 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Katnal2Q9D3R6 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Katnal2Q9D3R6 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Katnal2Q9D3R6 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Katnal2Q9D3R6 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Katnal2Q9D3R6 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Katnal2Q9D3R6 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Katnal2Q9D3R6 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Katnal2Q9D3R6 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Katnal2Q9D3R6 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Katnal2Q9D3R6 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Katnal2Q9D3R6 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Katnal2Q9D3R6 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Katnal2Q9D3R6 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Katnal2Q9D3R6 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Katnal2Q9D3R6 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Katnal2Q9D3R6 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Katnal2Q9D3R6 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Katnal2Q9D3R6 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Katnal2Q9D3R6 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Katnal2Q9D3R6 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Katnal2Q9D3R6 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Katnal2Q9D3R6 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Katnal2Q9D3R6 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Katnal2Q9D3R6 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Katnal2Q9D3R6 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Katnal2Q9D3R6 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Katnal2Q9D3R6 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Katnal2Q9D3R6 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Katnal2Q9D3R6 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Katnal2Q9D3R6 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Katnal2Q9D3R6 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Katnal2Q9D3R6 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Katnal2Q9D3R6 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Katnal2Q9D3R6 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Katnal2Q9D3R6 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Katnal2Q9D3R6 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Katnal2Q9D3R6 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Katnal2Q9D3R6 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Katnal2Q9D3R6 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Katnal2Q9D3R6 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Katnal2Q9D3R6 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Katnal2Q9D3R6 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Katnal2Q9D3R6 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Katnal2Q9D3R6 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Katnal2Q9D3R6 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Katnal2Q9D3R6 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Katnal2Q9D3R6 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Katnal2Q9D3R6 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Katnal2Q9D3R6 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Katnal2Q9D3R6 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Katnal2Q9D3R6 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Katnal2Q9D3R6 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Katnal2Q9D3R6 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Katnal2Q9D3R6 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Katnal2Q9D3R6 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Katnal2Q9D3R6 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Katnal2Q9D3R6 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Katnal2Q9D3R6 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Katnal2Q9D3R6 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Katnal2Q9D3R6 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Katnal2Q9D3R6 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Katnal2Q9D3R6 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms