Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q3

Uncharacterized protein C10orf88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D2Q3 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9D2Q3 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9D2Q3 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9D2Q3 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9D2Q3 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9D2Q3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9D2Q3 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9D2Q3 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9D2Q3 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9D2Q3 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9D2Q3 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9D2Q3 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9D2Q3 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9D2Q3 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9D2Q3 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9D2Q3 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9D2Q3 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9D2Q3 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9D2Q3 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9D2Q3 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9D2Q3 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9D2Q3 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9D2Q3 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9D2Q3 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9D2Q3 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9D2Q3 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9D2Q3 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9D2Q3 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9D2Q3 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9D2Q3 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9D2Q3 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9D2Q3 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9D2Q3 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9D2Q3 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9D2Q3 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9D2Q3 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9D2Q3 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9D2Q3 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9D2Q3 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9D2Q3 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9D2Q3 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9D2Q3 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9D2Q3 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9D2Q3 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9D2Q3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9D2Q3 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9D2Q3 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9D2Q3 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9D2Q3 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9D2Q3 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9D2Q3 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9D2Q3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9D2Q3 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9D2Q3 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9D2Q3 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9D2Q3 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9D2Q3 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9D2Q3 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9D2Q3 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9D2Q3 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9D2Q3 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9D2Q3 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9D2Q3 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9D2Q3 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9D2Q3 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9D2Q3 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9D2Q3 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9D2Q3 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9D2Q3 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9D2Q3 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9D2Q3 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9D2Q3 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9D2Q3 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9D2Q3 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9D2Q3 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9D2Q3 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9D2Q3 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9D2Q3 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9D2Q3 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9D2Q3 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9D2Q3 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9D2Q3 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9D2Q3 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9D2Q3 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9D2Q3 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9D2Q3 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9D2Q3 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9D2Q3 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9D2Q3 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9D2Q3 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9D2Q3 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9D2Q3 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9D2Q3 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9D2Q3 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9D2Q3 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9D2Q3 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9D2Q3 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9D2Q3 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9D2Q3 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9D2Q3 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms