Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H8

Fndc8, Fibronectin type III domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc8Q9D2H8 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fndc8Q9D2H8 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fndc8Q9D2H8 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fndc8Q9D2H8 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fndc8Q9D2H8 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fndc8Q9D2H8 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fndc8Q9D2H8 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fndc8Q9D2H8 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fndc8Q9D2H8 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fndc8Q9D2H8 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fndc8Q9D2H8 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fndc8Q9D2H8 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fndc8Q9D2H8 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fndc8Q9D2H8 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fndc8Q9D2H8 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fndc8Q9D2H8 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fndc8Q9D2H8 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fndc8Q9D2H8 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fndc8Q9D2H8 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Fndc8Q9D2H8 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fndc8Q9D2H8 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fndc8Q9D2H8 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fndc8Q9D2H8 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fndc8Q9D2H8 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fndc8Q9D2H8 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fndc8Q9D2H8 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fndc8Q9D2H8 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fndc8Q9D2H8 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fndc8Q9D2H8 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fndc8Q9D2H8 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fndc8Q9D2H8 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fndc8Q9D2H8 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fndc8Q9D2H8 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fndc8Q9D2H8 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fndc8Q9D2H8 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fndc8Q9D2H8 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fndc8Q9D2H8 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fndc8Q9D2H8 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fndc8Q9D2H8 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fndc8Q9D2H8 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fndc8Q9D2H8 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fndc8Q9D2H8 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fndc8Q9D2H8 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fndc8Q9D2H8 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fndc8Q9D2H8 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fndc8Q9D2H8 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fndc8Q9D2H8 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fndc8Q9D2H8 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fndc8Q9D2H8 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fndc8Q9D2H8 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fndc8Q9D2H8 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fndc8Q9D2H8 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fndc8Q9D2H8 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fndc8Q9D2H8 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fndc8Q9D2H8 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fndc8Q9D2H8 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fndc8Q9D2H8 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fndc8Q9D2H8 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fndc8Q9D2H8 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fndc8Q9D2H8 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fndc8Q9D2H8 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fndc8Q9D2H8 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fndc8Q9D2H8 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Fndc8Q9D2H8 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fndc8Q9D2H8 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fndc8Q9D2H8 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fndc8Q9D2H8 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Fndc8Q9D2H8 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fndc8Q9D2H8 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fndc8Q9D2H8 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fndc8Q9D2H8 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fndc8Q9D2H8 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fndc8Q9D2H8 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fndc8Q9D2H8 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fndc8Q9D2H8 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fndc8Q9D2H8 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fndc8Q9D2H8 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fndc8Q9D2H8 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fndc8Q9D2H8 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fndc8Q9D2H8 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fndc8Q9D2H8 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fndc8Q9D2H8 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fndc8Q9D2H8 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fndc8Q9D2H8 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fndc8Q9D2H8 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fndc8Q9D2H8 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fndc8Q9D2H8 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fndc8Q9D2H8 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fndc8Q9D2H8 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fndc8Q9D2H8 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fndc8Q9D2H8 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fndc8Q9D2H8 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fndc8Q9D2H8 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fndc8Q9D2H8 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fndc8Q9D2H8 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Fndc8Q9D2H8 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Fndc8Q9D2H8 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Fndc8Q9D2H8 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fndc8Q9D2H8 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fndc8Q9D2H8 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms